polimeraznaya tsepnaya reaktsiya (pcr)

PPT 20 pages 650.5 KB Free download

Page preview (5 pages)

Scroll down 👇
1 / 20
противовирусный иммунитет молекулярно-генетические методы диагностики полимеразную цепную реакцию (пцр, pcr) изобрел в 1983 году американский ученый кэри мюллис (kary mullis). принцип метода заключается в удвоении (амплификации) участка днк, ограниченного праймерами, при помощи фермента днк-полимеразы. за каждый следующий цикл амплификации происходит удвоение как исходного участка днк, так и вновь синтезированных фрагментов (амплификатов). в результате этого число фрагментов растет в геометрической прогрессии (цепная реакция). после 30 - 40 циклов их число превышает несколько миллиардов, что делает возможным их обнаружение различными методами. амплификация (лат. amplificatio — усиление, увеличение), в молекулярной биологии — увеличение числа копий днк. в клетке амплификация происходит в результате репликации днк, в искусственных условиях увеличения числа копий днк добиваются с помощью полимеразной цепной реакции. праймер — короткая олиго- или полинуклеотидная последовательность со свободной з’он-группой, комплементарно связанная с однонитевой днк или рнк; с его 3’-конца днк-полимераза начинает наращивать полидезоксирибонуклеотидную цепь. этапы пцр-исследования 1. выделение нуклеиновых кислот. на первом этапе выделяется вся …
2 / 20
в геометрической прогрессии. 3. учет результатов. накопленные продуты амплификации (большое число копий днк между местами посадки праймеров) можно выявить путем электрофореза в геле. помимо этого, при использовании флуоресцентно меченых зондов, возможен учет результатов по изменению флуоресценции относительно отрицательного контроля. компоненты реакции для проведения пцр в простейшем случае требуются следующие компоненты: днк-матрица, содержащая тот участок днк, который требуется амплифицировать. два праймера, комплементарные противоположным концам разных цепей требуемого фрагмента днк. термостабильная днк-полимераза — фермент, который катализирует реакцию полимеризации днк. полимераза для использования в пцр должна сохранять активность при высокой температуре длительное время, поэтому используют ферменты, выделенные из термофилов — thermus aquaticus (taq-полимераза), pyrococcus furiosus (pfu-полимераза), pyrococcus woesei (pwo-полимераза) и другие. дезоксирибонуклеозидтрифосфаты (datp, dgtp, dctp, dttp). ионы mg2+, необходимые для работы полимеразы. буферный раствор, обеспечивающий необходимые условия реакции — рн, ионную силу раствора. содержит соли, бычий сывороточный альбумин. для того, чтобы выявить и размножить в имеющейся пробе именно ту последовательность днк, которая необходима, …
3 / 20
атура отжига зависит от состава праймеров и обычно выбирается на 4—5°с ниже их температуры плавления. время стадии — 0,5—2 мин. неправильный выбор температуры отжига приводит либо к плохому связыванию праймеров с матрицей (при завышенной температуре), либо к связыванию в неверном месте и появлению неспецифических продуктов (при заниженной температуре). главный элемент pcr - это многократный тепловой цикл, при котором образец днк подвергается воздействию трёх различных температур. третья стадия - элонгация полимераза - это фермент, умеющий достраивать вторую цепь днк. для того, чтобы начать это делать, ей нужен кусочек, где днк уже двуцепочечная, в этом качестве и выступает место взаимодействия днк с праймером. полимераза всегда достраивает цепь от 5' к 3'-концу (эти названия связаны с ориентацией сахара дезоксирибозы в цепи; в обычной двуцепочечной днк цепи направлены противоположно друг другу: 5'_____________3' 3'_____________5' часто используемые полимеразы taq и pfu наиболее активны при 72 °c теперь в растворе есть четыре слишком длинных цепи днк. две …
4 / 20
ным количеством размноженных нужных участков, кусочков днк раствор наносят на гель, к гелю прикладывают напряжение. за часок-другой кусочки молекул днк (они имеют заряд) перемещаются в геле на расстояние, пропорциональное их массе. гель кладут под ультрафиолет и масса одинаковых кусочков днк начинает светиться в том месте геля, где собралась. если собралась — значит в днк был участок, соответствующий праймеру, нужный «ген». если ничего не светится, мутная полоска без четкого участка — значит, нужного участка в днк нет. четвертая стадия - детекция. схема удвоения фрагментов днк в пцр (andy vierstraete, 2001) схема удвоения фрагментов днк в пцр для процесса амплификации необходимо, чтобы структура праймеров была идентична (комплементарна) участку исходной днк. если этого не происходит (отсутствует специфическая днк), то удвоения днк не происходит. если в растворе не окажется ни одной молекулы днк с участком, комплементарным внесенным праймерам, то реакция пцр не пойдет, даже несмотря на то, что в растворе будет плавать миллион других …
5 / 20
шинства современных тест-систем составляет от 10 до 100 копий днк. это значительно превышает чувствительность культуральных методов исследования. 4. малый объем биологического материала. проведение анализа возможно в минимальном объеме пробы (до нескольких микролитров), что крайне важно в педиатрии, неонатологии, неврологии, судебной медицине. 5. возможность диагностики не только острых, но и латентных инфекций.особенно эффективен метод пцр для диагностики трудно культивируемых, некультивируемых и персистирующих форм микроорганизмов, с которыми часто приходится сталкиваться при латентных и хронических инфекциях. недостатки метода пцр 1. амплифицируется днк как живого, так и погибшего микроорганизма.это налагает определенные требования при использовании пцр для контроля эффективности лечения. в общем случае подобный контроль должен проводиться спустя промежуток времени, втечение которого происходит полная элиминация возбудителя. однако, метод nasba выявляет рнк только живых микроорганизмов и позволяет избежать этих ограничений. 2. высокая чувствительность. ряд микроорганизмов (условно - патогенная флора, упф) в норме может существовать у человека в малом количестве. при помощи метода пцр определяются даже самые …

Want to read more?

Download all 20 pages for free via Telegram.

Download full file

About "polimeraznaya tsepnaya reaktsiya (pcr)"

противовирусный иммунитет молекулярно-генетические методы диагностики полимеразную цепную реакцию (пцр, pcr) изобрел в 1983 году американский ученый кэри мюллис (kary mullis). принцип метода заключается в удвоении (амплификации) участка днк, ограниченного праймерами, при помощи фермента днк-полимеразы. за каждый следующий цикл амплификации происходит удвоение как исходного участка днк, так и вновь синтезированных фрагментов (амплификатов). в результате этого число фрагментов растет в геометрической прогрессии (цепная реакция). после 30 - 40 циклов их число превышает несколько миллиардов, что делает возможным их обнаружение различными методами. амплификация (лат. amplificatio — усиление, увеличение), в молекулярной биологии — увеличение числа копий днк. в клетке амплификация происходит в ре...

This file contains 20 pages in PPT format (650.5 KB). To download "polimeraznaya tsepnaya reaktsiya (pcr)", click the Telegram button on the left.

Tags: polimeraznaya tsepnaya reaktsiy… PPT 20 pages Free download Telegram