оқсилларнинг иккиламчи структураси

DOC 1.2 MB Free download

Page preview (5 pages)

Scroll down 👇
1
1403862919_47909.doc c n c c n c c o h h o h r j w y a a a i+1 i-1 , c o n c h h r c o , , a c nh nh c o r h a c c c n o h a a y j w n h c o c o r h , , + - - + c o r h hn nh - + c c c a a h o y = 0 w = 0 j = 0 c c n c h r h h r o 1 3 2 c1-c2 = 1,53 íì c2-n = 1,32 íì n-c3 = 1, 47 íì c=o = 1,24 íì c1-c2-n = 116 c1-c2-o = 121 c2-n-c3 = 123 o-c2-n = 123 o o o o о=силларнинг иккиламчи структураси оқсилларнинг иккиламчи структураси режа. 1. (-аминокислоталарнинг фазовий тузилиши. 2. …
2
га мувофиқ d- ёки l-аминокислоталар дейилади. оқсиллар таркибига кирувчи аминокислоталар l-аминокислоталар ҳисобланади. соон соон н-с-nh2 nh2-c-h r r d-изомер l-изомер аминокислоталарнинг d ёки l изомер эканлигини, яъни нисбий конфигурациясини уларнинг фазовий тузилишини глицерин альдегидининг фазовий тузилишига таққослаш билан амалга оширилади. масалан, буни аланин ва серин мисолида, фишернинг проекцион формулалари ёрдамида кўриш мумкин: cho cooh cooh ho-c-h nh2-c-h nh2-c-h ch2oh ch3 ch2oh l-глицерин l-аланин l-серин альдегиди d-аминокислоталар эса аксинча конфигурацияга эга. cho cooh cooh h-c-оh h-c- nh2 h-c- nh2 ch2oh ch3 ch2oh d-глицерин d-аланин d-серин альдегиди аминокислоталарнинг d ёки l қаторга мансублиги уларни қутбланган нурни ўнгга ёки чапга буриши билан боғлиқ эмас. уларнинг қутбланган нурни ўнгга ёки чапга бўриши экспериментал йўл билан топилади. ўнгга бурувчи изомер (қ) ишора билан, чапга бурувчи изомер (-) ишора билан ифодаланади. масалан, d(қ)-серин, d(-)-серин каби. шунингдек, бу ходиса ён радикал табиатига ва текшириш шароитларига ҳам боғлиқ. хозирда оптик изомерларнинг r,s-номенклатураси кўпроқ ишлатилмоқда. d-қатор аминокислоталарни баъзан табиий …
3
г эса с-(-l ва с-(-d конфигурацияли изомерлари биологик аҳамиятга эга. соон соон cooh cooh nh2-c-h h-c-nh2 nh2-c-h h-c-nh2 h-c-оh hо-c-h hо-c-ch3 h-c-оh ch3 ch3 ch3 ch3 l-треонин d-треонин l-аллотреонин d-аллотреонин пирролидин ҳалкасига гидроксил гуруҳ киритилиши билан (гидроксипролин) унинг алло-шакллари ҳосил бўлади. бунда гидроксил ва карбоксил гуруҳлар цис- холатда бўлади. цистин молекуласида ҳам иккита хираллик маркази мавжуд. лекин, унда симметрия текислиги бўлганлиги учун учта стереоизомер ҳосил бўлади. цистиннинг мезо-шакли оптик фаолликка эга эмас. оқсиллар гидролиз қилинганда l аминокислоталар ҳосил бўлади. аминокислоталар кимёвий синтез қилинганда иккала изомернинг аралашмаси чиқади. изомерларни ажратиш учун хроматография, бўлиб кристаллаш, органик асослар (масалан бруцин, стрихнин алкалоидлари) билан тузлар ҳосил қилиш усулларидан фойдаланилади. изомерларни ажратишда ацилаза ферментларидан фойдаланиш нисбатан самарали усул ҳисобланади. бунда дастлаб аралашма ацилланади, сўнг фермент таъсирида гидролиз қилинади. фермент фақат l-ациламинокислотани гидролизлайди. ацилланган аминокислоталар эрувчанлиги билан фарқ қилганлиги учун уларни осон ажратиш мумкин. саноат миқёсида d ва l аминокислоталарни ажратиш учун оптик актив адсорбентларда хроматография …
4
ooch3 nh2 ch2c6h5 оқсиллар ва пептидларнинг асосий структура бирлиги пептид (амид) боғ ҳисобланади. замонавий маълумотларга кўра оқсиллардаги пептид боғ ясси тузилишга эга: пептид боғида углерод атоми sp2 гибридланаган холатда бўлади. электрон тузилиш назариясига кўра пептид боғи уч марказли р, (-системадан ташкил топган. бу системада карбонил гуруҳнинг (-электронлари ва азот атомининг n-электронлари бир-бири билан қопланади. одатдаги шароитда ясси системадан бироз четга чиқиш кузатилади (5-10о атрофида). пептид боғидаги c-n боғи одатдагидан 0,015 нм қисқа, с-о боғи эса 0,003 нм узунроқдир, яъни, c-n кисман кўшбоғ табиатига эга. пептид боғи динамик боғ бўлиб, уни фақат валент боғи оркали ифодалаш мумкин эмас. карбонил гуруҳнинг (-электрон системаси ва азот атомининг жуфтлашмаган электронларининг ўзаро таъсири натижасида c-n боғи атрофида молекуланинг бурилиши қийинлашади. бурилишнинг барьер энергияси 63-84 кжни ташкил этади. одатда пептид боғлар транс-конфигурацияга эга. кучланган циклик системаларда (циклопептидлар, пролин ҳосилалари ва б.), шунингдек, n-алкил алмашинган ҳосилаларда ўринбосарларнинг хажми катта бўлса пептид боғи ясси цис- шаклда бўлиши ҳам …
5
жирининг мунтазам структураси турли усуллар ёрдамида осон аниқланадиган стандарт конформациялар ҳосил бўлишини белгилайди. co- ва nh-гуруҳлари орасидаги водород боғлар ҳисобига барқарорланган тартибланган пептид қисмлари иккиламчи структура элементлари дейилади. полипептид занжирнинг (-cпирал конформацияси. юқорида кўриб ўтганимиздек, оқсиллар ва пептидларнинг молекуласида кимёвий боғлар атрофида айланиш турлича бўлади. бундан келиб чиқиб 1950 йилда л.полинг ва р.кори полипептид занжир учун ўнг томонга буралган спирал тузилиш энергетик жиҳатдан қулай эканлигини кўрсатдилар ва бундай тузилишни (-спирал деб аташни таклиф қилдилар. (-спирал полипептид занжирининг асосий фазовий шаклларидан бири ҳисобланади. бундай конформациянинг барқарорлигида водород боғларнинг аҳамияти катта бўлиб, (-спирал тузилишда водород боғлар карбонил гуруҳ кислород атоми ва ҳар бешинчи аминокислота қолдиғидаги аминогуруҳ водороди ҳисобига ҳосил бўлади. полипептид занжири гўёки цилиндрнинг атрофига ўралган шаклга эга бўлади. ён занжирлар цилиндрнинг ташқи сиртини эгаллайди ва цилиндрнинг гидрофил ёки гидрофоб табиатини белгилайди. (-спиралнинг радиуси 0,23 нм, спиралнинг иккита бўлаги орасидаги масофа 0,54 нмга тенг. битта бўлакка 3,6 та аминокислота қолдиғи тўғри келади. …

Want to read more?

Download the full file for free via Telegram.

Download full file

About "оқсилларнинг иккиламчи структураси"

1403862919_47909.doc c n c c n c c o h h o h r j w y a a a i+1 i-1 , c o n c h h r c o , , a c nh nh c o r h a c c c n o h a a y j w n h c o c o r h , , + - - + c o r h hn nh - + c c c a a h o y = 0 w = 0 j = 0 c c n c h r h h r o 1 3 2 c1-c2 = 1,53 íì c2-n = 1,32 íì n-c3 = 1, 47 íì c=o = …

DOC format, 1.2 MB. To download "оқсилларнинг иккиламчи структураси", click the Telegram button on the left.