Back

bioinformatika: fan tarixi va rivojlanishi

PPT 33 pages 3.5 MB Free download

Page preview (5 pages)

Scroll down 👇
1 / 33
базы и банки данных. лекция №2 маърузачи: кушанов ф.н. режа: биоинформатиканинг фан сифатида шаклланиш тарихи. унинг предмети, вазифалари ва объектлари. замонавий биологик тадқиқотдарда биоинформатиканинг аҳамияти. биоинформатика ривожланиш бочқичлари ва ютуқлари. ген онтологияси биоинформатика ўзи нима? математик ҳисоблаш усуллари ҳамда информацион технологиялар ёрдамида турли хил биологиядаги муаммоларни ечиш билан шуғулланадиган фан соҳаси * биоинформатика тарихи биоинформатиканинг яралиш тарихи 13 асрларга бориб тақалади. математика тарихига фибоначчи (fibonacci) номи билан кириб келган ёш итальян леонардо (leonardo of pisa) биологик жараённинг биринчи математик моделини тузган ҳолда қуёнларнинг кўпайиши тўғрисидаги масалани тавсифлаб берган. хх асрнинг 20 йилларига келиб яна бир итальян олими вито вольтерра (vito volterra) “ўлжа-йиртқич” кўринишидаги икки биологик турнинг ўзаро ҳаракат моделини яратди. 40 йиллар охирида биологияга физик ва математиклар кириб кела бошлади. биологиянинг замонавий тарихи 1953 йилдан, америка олимлари жеймс уотсон (james watson) ҳамда фрэнсис крик (francis crick) томонидан днк нинг қўш спираллиги кашф қилинган даврдан бошланди. биоинформатика асосчилари лайнус полинг 1962 …
2 / 33
ҳар бир омилнинг эслаб қолиниши ва таҳлил қилинишида инсон имкониятлари чегараланиб қолганлиги ҳамда тобора кўпайиб бораётган ахборот хажмини саҳлаш зарурияти туғилганлиги билан боғланади. илк кетма-кетликлари аниқланган бир неча юз оқсиллар ҳақида маълумотлар китоб-атлас шаклида нашр қилинган эди. structural genomics pharmaco-genomics functional genomics proteomics genomics bioinformatics * геном – термини 1920 йилда немис ботаниги ганс винклер томонидан хромосоманинг тўлиқ (гаплоид) тўпламини ташкил этувчи генлар коллекциясини тавсифлаш мақсадида киритилди геномика – термини эса 1986 йилда генетик томас родерик томонидан геномларни карталаштириш, секвенслаш ва тавсифлашни масадида киритилди. дастлабки“маълумотлар банки” оқсил кетма-кетликлари ва уларнинг тузилиши бўйича атлас-китоб 1965 -1978 * swiss-prot маълумотлар банки 1986 swiss-prot – оқсил кетма-кетликлари маълумотлар базаси http://www.expasy.org/sprot/ амос байрох - швейцарядаги биоинформатика институти swiss-prot гуруҳи раҳбари хужжатлар миқдорининг ўсиш суръатлари 24 январь 2006 йилда 206,586 хужжат 1986 2006 2001 swiss-prot маълумотлар банки trembl маълумотлар банки embl маълумотлар банкидан кодланадиган нуклеотидлар кетма-кетлигининг қонуний трансляцияси автоматик классификация ва аннотация trembl (translated embl) …
3 / 33
actagaacgctcagcagagcagccacagaaaaattgtacatcttgtgctggataaagattaacggtttcttcgtgatataaacgataggagtaactcttctgcagggagaccaaataattcttcatcttttactgttgctgcgagcgtagttaaatgctcaaaatcttctggtgtaccagaaccatcaggcataatttgtaataacatacctgctgccactggcttgccttcatattctccagtacgaataattaattgagtttgaagactcatattttcagtgaagtttcgatcgcccttaggaggggccgcgctttctctttcaa pir-psd биоинфрматика сервис марказлари ва ресурслари геномни секвенслаш (нуклеотид кетма-кетлигини аниқлаш) биоинформатикада фойдаланиладиган файллар форматлари fasta >roa1_drome rea guano receptor type iii >> 0.1 mvnsnqnqngnsnghdddfpqdsitepehmrklfiggldyrttdenlkahekwgnivdvvvmkdprtkrsrgfgfityshssmideaqksrphkidgrvepkravprqdidspnagatvkklfvgalkddhdeqsirdyfqhfgnivdnividketgkkrgfafvefddydpvdkvvlqkqhqlngkmvdvkkalpkndqqgggggrggpggraggnrgnmgggnygnqngggnwnnggnnwgnnrgndnwgnnsfgggggggggygggnnswgnnnpwdngngggnfggggnnwnggndfggyqqnygggpqrgggnfnnnrmqpyqggggfkagggnqgnygnnqgfnnggnnrry >roa2_drome rea guano ligand mvnsnqnqngnsnghdddfpqdsitepehmrklfiggldyrttdenlkahekwgnivdvvvmkdptststststststststmideaqksrphkidgrvepkravprqdidspnagatvkklfvgalkddhdeqsirdyfqhllllllldlllldlllldlllfvefddydpvdkvvlqk qhqlngkmvdvkkalpkndqqgggggrggpggraggnrgnmgggnygnqngggnwnnggnnwgnnrgndnwgnnsfgggggggggygggnnswgnnnpwdngngggnfggggnnwnggndfggyqqnygggpqrgggnfnnnrmqpyqggggfkagggnqgnygnnqgfnnggnnrry * genbank locus scu49845 5028 bp dna pln 21-jun-1999 definition saccharomyces cerevisiae tcp1-beta gene, partial cds, and axl2p (axl2) and rev7p (rev7) genes, complete cds. accession u49845 version u49845.1 gi:1293613 keywords . source saccharomyces cerevisiae (baker's yeast) organism saccharomyces cerevisiae eukaryota; fungi; ascomycota; saccharomycotina; saccharomycetes; saccharomycetales; saccharomycetaceae; saccharomyces. reference 1 (bases 1 to 5028) authors torpey,l.e., gibbs,p.e., nelson,j. and lawrence,c.w. title cloning and sequence of rev7, a gene whose function is required for dna damage-induced mutagenesis in saccharomyces cerevisiae journal yeast 10 (11), 1503-1509 (1994) pubmed 7871890
4 / 33
reference 2 (bases 1 to 5028) authors roemer,t., madden,k., chang,j. and snyder,m. title selection of axial growth sites in yeast requires axl2p, a novel plasma membrane glycoprotein journal genes dev. 10 (7), 777-793 (1996) pubmed 8846915 reference 3 (bases 1 to 5028) authors roemer,t. title direct submission journal submitted (22-feb-1996) terry roemer, biology, yale university, new haven, ct, usa features location/qualifiers source 1..5028 /organism="saccharomyces cerevisiae" /db_xref="taxon:4932" /chromosome="ix" /map="9" cds <1..206 /codon_start=3 /product="tcp1-beta" /protein_id="aaa98665.1" /db_xref="gi:1293614" /translation="ssiyngistsgldlnngtiadmrqlgivesyklkravvssasea aevllrvdniirarprtanrqhm" gene 687..3158 /gene="axl2" cds 687..3158 /gene="axl2" /note="plasma membrane glycoprotein" /codon_start=1 /function="required for axial budding pattern of s. cerevisiae" /product="axl2p" /protein_id="aaa98666.1" /db_xref="gi:1293615" /translation="mtqlqisllltatisllhlvvatpyeaypigkqyppvarvnesf tfqisndtykssvdktaqityncfdlpswlsfdsssrtfsgepssdllsdanttlyfn ------------------------------------------//--------------------------------------------------------- ygsqktvdteklfdleapekekrtsrdvtmssldpwnsnispspvrksvtpspynvtk rnrhlqniqdsqsgkngitpttmstsssddfvpvkdgenfcwvhsmepdrrpskkrl vdfsnksnvnvgqvkdihgripeml" gene complement(3300..4037) /gene="rev7" cds complement(3300..4037) /gene="rev7" /codon_start=1 /product="rev7p" /protein_id="aaa98667.1" /db_xref="gi:1293616" /translation="mnrwvekwlrvylkcyinlilfyrnvyppqsfdyttyqsfnlpq fvpinrhpalidyieelildvlsklthvyrfsiciinkkndlciekyvldfselqhvd kddqiitetevfdefrsslnslimhleklpkvnddtitfeavinaielelghkldrnr rvdsleekaeierdsnwvkcqedenlpdnngfqppkikltslvgsdvgpliihqfsek lisgddkilngvysqyeegesifgslf" origin 1 gatcctccat atacaacggt atctccacct caggtttaga tctcaacaac ggaaccattg 61 ccgacatgag acagttaggt atcgtcgaga gttacaagct aaaacgagca gtagtcagct 121 ctgcatctga agccgctgaa gttctactaa gggtggataa catcatccgt gcaagaccaa 181 gaaccgccaa tagacaacat atgtaacata tttaggatat acc
5 / 33
tcgaaaa taataaaccg 241 ccacactgtc attattataa ttagaaacag aacgcaaaaa ttatccacta tataattcaa 301 agacgcgaaa aaaaaagaac aacgcgtcat agaacttttg gcaattcgcg tcacaaataa ------------------------------------------//---------------------------------------------- 4621 tcttcgcact tcttttccca ttcatctctt tcttcttcca aagcaacgat ccttctaccc 4681 atttgctcag agttcaaatc ggcctctttc agtttatcca ttgcttcctt cagtttggct 4741 tcactgtctt ctagctgttg ttctagatcc tggtttttct tggtgtagtt ctcattatta 4801 gatctcaagt tattggagtc ttcagccaat tgctttgtat cagacaattg actctctaac 4861 ttctccactt cactgtcgag ttgctcgttt ttagcggaca aagatttaat ctcgttttct 4921 ttttcagtgt tagattgctc taattctttg agctgttctc tcagctcctc atatttttct 4981 tgccatgact cagattctaa ttttaagcta ttcaatttct ctttgatc // * генларни хариталаш “одам геноми” лойиҳаси 1990-2003 * геном революцияси геномни карталаштириш геномни секвенслаш геномни аннотациялаш (генларни аниқлаш) функционал таҳлил одам геномини ўрганиш бўйича илмий тадқиқотлар – яъни, одам геноми харитасини тузиб чиқиш ишлари ақш да 1984–йилда режалаштирилган. 20 асрнинг 70 йиллари бошларигача одам генетик карталари тузиш жуда секин даражада ривожланган. одамнинг биринчи гени (рангни ажрата олмаслик гени) 1911 йилда х-хромосомасида карталаштирилган. биринчи аутосом гени 1968 йилда карталаштирилган. 1973 йилга келиб одам хромасомасида 64 та ген карталаштирилган. 1994 йилда эса 5000 структур генлар ва …

Want to read more?

Download all 33 pages for free via Telegram.

Download full file

About "bioinformatika: fan tarixi va rivojlanishi"

базы и банки данных. лекция №2 маърузачи: кушанов ф.н. режа: биоинформатиканинг фан сифатида шаклланиш тарихи. унинг предмети, вазифалари ва объектлари. замонавий биологик тадқиқотдарда биоинформатиканинг аҳамияти. биоинформатика ривожланиш бочқичлари ва ютуқлари. ген онтологияси биоинформатика ўзи нима? математик ҳисоблаш усуллари ҳамда информацион технологиялар ёрдамида турли хил биологиядаги муаммоларни ечиш билан шуғулланадиган фан соҳаси * биоинформатика тарихи биоинформатиканинг яралиш тарихи 13 асрларга бориб тақалади. математика тарихига фибоначчи (fibonacci) номи билан кириб келган ёш итальян леонардо (leonardo of pisa) биологик жараённинг биринчи математик моделини тузган ҳолда қуёнларнинг кўпайиши тўғрисидаги масалани тавсифлаб берган. хх асрнинг 20 йилларига келиб яна бир италь...

This file contains 33 pages in PPT format (3.5 MB). To download "bioinformatika: fan tarixi va rivojlanishi", click the Telegram button on the left.

Tags: bioinformatika: fan tarixi va r… PPT 33 pages Free download Telegram

Similar files

You might also like these

Show all
bioinformatika — PPT PPT
bioinformatika
33 pages 3.4 MB
biologiya ta'lim yo'nalishi - genetika va genomika asoslar — DOCX DOCX
biologiya ta'lim yo'nalishi - genetika va genomika asoslar
19 pages 2.0 MB