molekulyar filogenetika. zamonaviy bioinformatsion dasturlar (clustalw2, t,coffee va boshqalar)

PPTX 2,1 МБ Бесплатная загрузка

Предварительный просмотр (5 стр.)

Прокрутите вниз 👇

1681208682.pptx /docprops/thumbnail.jpeg molekulyar filogenetika. _x000b_zamonaviy bioinformatsion dasturlar (clustalw2, t,coffee va boshqalar) ppt molekulyar filogenetika. zamonaviy bioinformatsion dasturlar (clustalw2, t,coffee va boshqalar) reja: molekulyar filogenetika. filogenetikaning asosiy tushunchalari. filogenetik daraxtlarning tiplari. genlarni solishtirish asosida filogenetik yaqinlikni aniqlash. filogenetik daraxtlar klassifikatsiyasi. filogenetik bog’lanishlarni aniqlash filogenetik qarindoshlikni o’rnatish zamonaviy bioinformatsion dasturlar filogenez (yun. phylon — avlod, qabila va ... genez), filogeneya — tirik organizmlar hamda ular taksonomik guruxlari: olam, tip (boʻlim), sinf, turkum (tartib), oila, avlod (turkum, urugʻ) va turlarning tarixiy taraqqiyoti. "filogenez" termini nemis olimi e. gekkel tomonidan fanga kiritilgan (1866). biologiyaning filogenez va uning qonuniyatlarini oʻrganadigan boʻlimi filogenetika deyiladi. filogenetikani tadqiq qilish evolyutsiyaning umumiy nazariyasini rivojlantirish, organizmlarning tabiiy sistemasini tuzish uchun zarur. filogenetikaning xulosalari tarixiy geologiya uchun ham juda muhim. gekkel filogenezni tadqiq qilish uchun paleontologiya, solishtirma anatomiya va embriologiya dalillarini taqqoslovchi uchlik parallelizm metodini taklif etgan. filogenetikada genetika, biokimyo, molekulyar biologiya, etologiya, biogeografiya, fiziologiya, parazitologiya dalillaridan keng foydalanilmoqda. bu dalillar …

elgilarning dastlabki umumiy formadan raduis boʻylab har tomonga tarqalish xarakteriga ega. oʻsimlik va hayvonlar filogenezi shajara daraxtini chizish yordamida tasvirlab beriladi. shajara daraxti oʻsimlik va hayvonlarning umumiy bir ildizdan kelib chiqqanligi; turli xil formalar yerdagi hayot tarixining har xil davrlarda shoxlanish orqali asta-sekin taraqqiy etganligini aks ettiradi. organizmlar filogenetik qayta tuzilishlarining adaptiv xarakterini belgilovchi asosiy kuch tabiiy tanlanish hisoblanadi. filogenetik shajara barcha oʻzgarishlarning birlamchi negizida divergensiya va filetik evolyutsiya, soʻng esa parallelizm va konvergensiya yotadi. organizm har xil guruhlarining filogenezi bir xilda oʻrganilmagan, bu qazilma qoldiklarning har xil darajada saqlanganligi va mazkur guruxlarning qanchalik qadimiyligi bilan bogʻliq. umurtqali hayvonlar (ayniqsa, yuksak guruhlari) va yuksak oʻsimliklar filogenezi, umurtqasiz hayvonlardan esa mollyuskalar, ignaterililar, boʻgʻimoyoqlilar filogenezi nisbatan yaxshi, prokariotlar va tuban oʻsimliklar filogenezi kamroq oʻrganilgan. filogenetik daraxt organizmlar oʻrtasidagi evolyutsion aloqalarni ifodalovchi diagrammadir. filogenetik daraxtlar aniq faktlar emas, balki farazlardir. filogenetik daraxtdagi shoxlanish qonuniyati turlar yoki boshqa guruhlarning umumiy ajdoddan qanday kelib chiqqanligini …

ning jismoniy belgilari yoki genlarining dnk ketma-ketliklari kabi toʻplagan maʼlumotlarimiz asosida yaratiladi. siz bu haqda filogenetik daraxtlarni tuzish nomli maqolada yanada koʻproq maʼlumot bilib olishingiz mumkin. filogenetik daraxtda bizni qiziqtirgan turlar yoki guruhlar daraxt shoxlari uchida joylashadi. misol uchun, quyidagi filogenetik daraxt beshta tur: a, b, c, d va e turlar orasidagi aloqalarni koʻrsatib, ular daraxt shoxlarining uchida joylashtirilgan. filogenetik daraxtning tuzilishi filogenetik daraxt shoxlarining qanday joylashgani bizning berilgan turlarning umumiy ajdoddan qanday kelib chiqqanligi haqidagi tushunchalarimizni ifodalaydi. har bir shoxlanish nuqtasi (ichki tugun deb ham ataladi) divergensiya hodisasi yoki bitta ajdodning ikki yoki undan ortiq turlarga ajralishini koʻrsatadi. har bir shoxlanish nuqtasida ushbu shoxlar uchida joylashgan barcha turlarning eng soʻnggi umumiy ajdodi joylashgan. misol uchun, a va b turlar ajralib chiqqan shoxlanish nuqtasida ushbu turlarning eng soʻnggi umumiy ajdodi keltirilgan. daraxtning pastki qismi yoki ildizi tepasidagi birinchi shoxlanish nuqtasida barcha turlarning (a, b, c, d, e) umumiy ajdodi keltirilgan. …

in ba'zi konservativ joylar boshqalar ostida joylashgan bo'ladi. barcha dnk molekulalari shakar, fosfat guruhi va to'rtta nuklein kislotalardan biri: adenin, sitozin, guanin va timinni o'z ichiga olgan nukleotidlardan iborat. ularning bosh harflari dnk alifbosini hosil qiladi. (a, c, g; t) dnk alifbosi uchun bir harfli qisqartmalar a adenin c sitozin g guanin t timin r purinlar (a, g) y piramidinlar (c, t) kuchli aloqalar (c, g) w zaif aloqalar (a, t) dnk alifbosi a alanin p prolin b aspartat/asparagin q glutamin c sistin r arginin d aspartat s serin e glutamat t treonin f fenilalanin u selenotsistein g glisin v valin h histidin w triptofan i izolösin y tirozin k lizin z glutamat/glutamin l leysin x har qanday m metionin * tarjima to'xtashi n asparagin - noaniq uzunlikdagi bo'shliq aminokislota so'rovlari ketma-ketligini (blastp va tblastn) ishlatadigan dasturlar uchun qabul qilingan aminokislota kodlari: phylonet, ils, hgt va boshqalarni hisobga olgan holda …

ika va vositalardan foydalanadi va shuning uchun phylonet to'plami filogenetik daraxtlarni tahlil qilish uchun bir nechta vositalarni o'z ichiga oladi. phylonet professor luay nakhleh ( nakhleh@cs.rice.edu ) tomonidan boshqariladigan raysning bioinformatics group tomonidan ishlab chiqilgan, amalga oshirilgan va ta'minlangan dastur phylonet splitstree - bu ketma-ketlik , masofa matritsasi yoki daraxtlar to'plami kabi turli xil ma'lumotlardan filogenetik daraxtlar , filogenetik tarmoqlar yoki umuman olganda, grafiklarni ajratish uchun mashhur bepul dastur . [1] [2] splitstree split dekompozitsiya, [3] qo'shni tarmoq , konsensus tarmoqlari, [4] super tarmoqlar usullari yoki gibridizatsiya yoki oddiy rekombinatsiya tarmoqlarini hisoblash usullari kabi nashr etilgan usullarni qo'llaydi . u nexus fayl formatidan foydalanadi . splits grafigi maxsus ma'lumotlar bloki (splits bloki) yordamida aniqlanadi. splitstree dendroskop interaktiv hisoblanadi kompyuter dasturlari yozilgan dastur java uchun ko'rish filogenetik daraxtlar.[1] ushbu dastur har xil o'lchamdagi daraxtlarni ko'rish uchun mo'ljallangan va raqamlar yaratish uchun juda foydali. bu daniel huson va uning hamkasblari tomonidan ishlab …

Хотите читать дальше?

Скачайте полный файл бесплатно через Telegram.

Скачать полный файл

О "molekulyar filogenetika. zamonaviy bioinformatsion dasturlar (clustalw2, t,coffee va boshqalar)"

1681208682.pptx /docprops/thumbnail.jpeg molekulyar filogenetika. _x000b_zamonaviy bioinformatsion dasturlar (clustalw2, t,coffee va boshqalar) ppt molekulyar filogenetika. zamonaviy bioinformatsion dasturlar (clustalw2, t,coffee va boshqalar) reja: molekulyar filogenetika. filogenetikaning asosiy tushunchalari. filogenetik daraxtlarning tiplari. genlarni solishtirish asosida filogenetik yaqinlikni aniqlash. filogenetik daraxtlar klassifikatsiyasi. filogenetik bog’lanishlarni aniqlash filogenetik qarindoshlikni o’rnatish zamonaviy bioinformatsion dasturlar filogenez (yun. phylon — avlod, qabila va ... genez), filogeneya — tirik organizmlar hamda ular taksonomik guruxlari: olam, tip (boʻlim), sinf, turkum (tartib), oila, avlod (turkum, urugʻ) va turlarning tarixiy taraqqiyoti. "filogenez" t...

Формат PPTX, 2,1 МБ. Чтобы скачать "molekulyar filogenetika. zamonaviy bioinformatsion dasturlar (clustalw2, t,coffee va boshqalar)", нажмите кнопку Telegram слева.

Теги: molekulyar filogenetika. zamona… PPTX Бесплатная загрузка Telegram