zamonaviy bioinformatsion ma’lumotlar bazalari

PPT 32 стр. 12,7 МБ Бесплатная загрузка

32 стр.

FaylHub.uz

Скачать через Telegram

Размер 12,7 МБ

Тип файла PPT

Страницы 32

Обновлено Дек 2025

Предварительный просмотр (5 стр.)

Прокрутите вниз 👇

1 / 32

презентация powerpoint 3 – ma’ruza: zamonaviy bioinformatsion ma’lumotlar bazalari. reja: 1. zamonaviy bioinformatsion malulotlar bazalari 2.nukleotidlar ketma-ketliklari bo’yicha ma’lumotlar bazalari. 3. nukleotidlar ketma – ketligini tahlilini amalga oshiruvchi dasturlar. 4. zamonaviy molekulyar – genetik ma’lumotlar bazalari va ularning umumiy tuzilishi. 5. odam genomi ketma ketligini aniqlash bo’yicha “odam genomi” loyihasi haqida. 6. turli organizmlar genomining xaritalanishi bo’yicha ma’lumotlar bazalari. 7. biologik axborotlarni saqlashiga ko’ra zamonaviy banklar. 8. odam genomi ketma ketligini aniqlash bo’yicha “odam genomi” loyihasi haqida. gen va genom haqida zamonaviy tasavvurlar. “gen” atamasi birinchi marta 1909 yilda botanik olim vilgelm iogansen tomonidan fanga kiritilgan bo’lib, 1865 yilda genetika fani tarixida gregor mendel tomonidan mashhur genetika qonuniyatlari (mendel qonunlari) asoslab berilgan. hozirgi vaqtda genetika jadal tarzda rivojlanayotgan va amaliy, nazariy jihatdan sezilarli yutuqlarga erishgan fan sifatida qayd qilinib, genlarning strukturasi, funktsiyasi, shuningdek dinamik xususiyatlari batafsil o’rganilgan. gen (yunon tilida γένος – avlod degan ma’noni ifodalaydi) – bu biologik tirik …

2 / 32

banklarni va ma’lumotlar bazalarini quyidagicha klassifikatsiyalash mumkin: bibliografik dnk, rnk va oqsillarning birlamchi strukturalari bo’yicha molekulalarning fazoviy strukturalari bo’yicha genomlar bo’yicha boshqa tipdagi ma’lumotlar bo’yicha www entrez retrieval system - internet tizimidagi ma’lumotlar banklari bilan ishlash vositasi hisoblanadi national center for biotechnology information (ncbi) tomonidan ishlab chiqilgan va uning tarkibiga kiritilgan ma’lumotlar bazalari dnk ketma-ketliklari bo’yicha genbank, embl, ddbj oqsillar ketma-ketliklari bo’yicha swiss-prot, pir, prf, pdb genomlar va alohida xromosomalarni xaritalash bo’yicha ma’lumotlar oqsillarning uchlamchi strukturalari bo’yicha ma’lumotlarni saqlovchi (mmdb) dunyodagi eng yirik bibliografik ma’lumotlar bazalaridan biri bu chemical abstracts hisoblanadi. bu bazada fanning turli sohalariga oid axborotlar saqlanadi. bu mb si orqali 190 ga yaqin maxsus ma’lumotlar bazalariga kirish imkoni mavjud, jumladan biologlar uchun foydali bo’lgan biosis va medline hisoblanadi. odam genomi ketma ketligini aniqlash bo’yicha “odam genomi” loyihasi haqida. loyihaning asosiy maqsadi - odam hujayrasi tarkibidagi barcha dnk molekulalaridagi ketma – ketliklarni aniqlash, shuningdek, ayni paytda barcha genlarning …

3 / 32

fizik xaritasini tuzish 3. barcha genomning alohida klonlar tipidagi xaritasini olish 4. 2004 yilda dnk ning to’liq sekvinirlanishini tugatish 5. odamning barcha genlarining sekvinirlangan xaritasini to’laligicha tugatish o’tkazilgan bir necha yillik tadqiqotlar natijasida nukleotidlarning ketma-ketliklari bo’yicha xalqaro ma’lumotlar bazalari (genbank/ embl/ ddbj/ pir/ swisspot) yaratildi va barcha olingan ma’lumotlar shu banklarga joylashtirildi. bu bazalarga kirish ochiq tarzda amalga oshiriladi va har bir mutaxassis kirib ulardagi ma’lumotlardan tadqiqot maqsadlarida foydalanishi mumkin. genlarni xaritalash bo’yicha birinchi tajribalar 1995 yilda hemophilus influenzae bakteriya genomida o’tkazildi. lekin bu bir yil ichida qilingan ish butun odam genomining mingdan bir qismidan ham kamrog’ini tashkil etardi. ammo, 1998 yilning iyulida 9% genom sekvinirlandi 1995 yilning yanvaridan 1996 yil yanvarigacha odam dnk sining barcha ketma-ketliklari o’rganilgan qismi o’n martaga ortdi odamdagi sekvinirlangan genlar sonining yillar bo’yicha ortib borishi (y o’qida sekvinirlangan genlar soni). 1998 yilning 23 oktyabriga kelib aniqlangan ketma – ketliklardagi odamning genlari soni 30181 taga yetdi. …

4 / 32

992 yilda clustal dasturining ikkinchi avlodi clustal v paydo bo’ldi va 1994 yilda ishlab chiqilgan uchinchi avlod clustal w dasturi takomillashtirilgan algoritmlarning hisobiga juda ham qulay ishlash interfeysiga ega bo’ldi. bu avlod dasturining qulayligi taqqoslanuvi ketma – ketliklarning fasta formati ko’rinishida berilishi bilan belgilanadi. clustal dasturining uchinchi avlodi ko’plab serverlar orqali ikki xil ko’rinishda, interfaol va pochta tartibida beriladi. (www.pbil.ibcp.fr, http://www.ebi.ac.uk) pochta tartibida ishlanganda esa natijalar foydalanuvchining elektron manziliga (ketma – ketliklar soni ko’p miqdorda bo’lganda) jo’natiladi. interfaol ko’rinishda foydalanuvchi natijalarni kutish orqali qabul qiladi. clustal dasturida ishlash uchun 1.o’rganilayotgan aminokislotalar yoki nukleotidlarning ketma – ketliklarini mumkin bo’lgan mavjud 7 ta serverlarning biridan (nbrf/pir, embl/swiss-prot, pearson/fasta, clustal(*aln), gcg/msf(pileup), gcg9/rsf, gde) olish kerak. bu holatlarda ko’proq fasta formatidan foydalaniladi. kiritilayotgan ketma –ketliklarning umumiy uzunligi www uchun 40000, e-mail serverlari uchun esa 60000 dan ortmasligi talab etiladi. juftlik taqqoslanishlarida o’rganilayotgan ketma – ketliklarning barcha juftliklari taqqoslanadi. bundan tashqari clustal dasturi taqqoslanayotgan ketma …

5 / 32

im) odamda uchraydigan genetik kasalliklar haqidagi to’liq ma’lumotlarni, genlar va ular tomonidan chaqiriladigan genetik sindromlarning fenotipik namoyon bo’lishi haqidagi genetik xaritalarni o’zida tutuvchi ma’lumotlar bazasi hisoblanadi. bu ma’lumotlar bazasida ishlashning qulayligi shundaki ma’lumotlarni izlash uchun qulay bo’lgan interfeysga ega. evolyutsion kelib chiqishi va funktsiyasiga ko’ra bir-biriga o’xshash bo’lgan genlar (gomologik) ko’p hollarda turli ko’rinishdagi turlarda gomologik genlar bilan bog’langan ko’rinishda bo’ladi. sizdan umumiy ma’lumotlardan foydalangan holda odam, sichqon, kalamush, sigir va cho’chqadagi chrnb1, cryb1, gaa, gh, nf1, tk1, tp53 genlarining subxromosomali lokalizatsiyasini topishiz mumkin bo’ladi human gene mutation database (hgmd) turli ko’rinishdagi nasliy kasalliklarga olib keluvchi yadro genlari mutatsiyalari to’liq tartibda berilgan. bazadagi ma’lumotlar har haftada yangilanadi. 1997 yil sentyabr holatiga ko’ra bu bazaning tarkibida 600 dan ortiq genlardagi mutatsiyalar haqidagi ma’lumotlar mavjud bo’lgan bo’lsa, keyingi o’n yillikda bu ma’lumotlarning miqdori bir necha barobarga ortib ketdi. bu bazaning tarkibida shuningdek, genom mutatsiyalari haqidagi ma’lumotlarni taqdim etuvchi turli maqolalar va xabarnomalar …

Хотите читать дальше?

Скачайте все 32 страниц бесплатно через Telegram.

Скачать полный файл

О "zamonaviy bioinformatsion ma’lumotlar bazalari"

презентация powerpoint 3 – ma’ruza: zamonaviy bioinformatsion ma’lumotlar bazalari. reja: 1. zamonaviy bioinformatsion malulotlar bazalari 2.nukleotidlar ketma-ketliklari bo’yicha ma’lumotlar bazalari. 3. nukleotidlar ketma – ketligini tahlilini amalga oshiruvchi dasturlar. 4. zamonaviy molekulyar – genetik ma’lumotlar bazalari va ularning umumiy tuzilishi. 5. odam genomi ketma ketligini aniqlash bo’yicha “odam genomi” loyihasi haqida. 6. turli organizmlar genomining xaritalanishi bo’yicha ma’lumotlar bazalari. 7. biologik axborotlarni saqlashiga ko’ra zamonaviy banklar. 8. odam genomi ketma ketligini aniqlash bo’yicha “odam genomi” loyihasi haqida. gen va genom haqida zamonaviy tasavvurlar. “gen” atamasi birinchi marta 1909 yilda botanik olim vilgelm iogansen tomonidan fanga kiritilgan bo...

Этот файл содержит 32 стр. в формате PPT (12,7 МБ). Чтобы скачать "zamonaviy bioinformatsion ma’lumotlar bazalari", нажмите кнопку Telegram слева.

Теги: zamonaviy bioinformatsion ma’lu… PPT 32 стр. Бесплатная загрузка Telegram