zamonaviy bioinformatik ma’lumotlar bazalari

DOCX 14 стр. 1,5 МБ Бесплатная загрузка

14 стр.

FaylHub.uz

Скачать через Telegram

Размер 1,5 МБ

Тип файла DOCX

Страницы 14

Обновлено Дек 2025

Предварительный просмотр (5 стр.)

Прокрутите вниз 👇

1 / 14

2-mavzu: zamonaviy bioinformatik ma’lumotlar bazalari reja: 1. zamonaviy bioinformatik ma’lumotlar bazalari 2. nukleotidlar ketma-ketligi bazalari-turlari va ahamiyati. 3. ddbj- ma’lumotlar bazasi-yaponiya 4. embl-tadqiqot markazi va ma’lumotlar bazasi-yevropa 5. ncbi – ma’lumotlar bazasi -genbank-aqsh 6. insdc – nukleotidlarning ketma-ketligi bo‘yicha xalqaro ma’lumotlar bazasi tayanch iboralar: ddbj, embl, ncbi, insdc, talen, crispr, tandem, xanthomonas, domen, genom lokuslari. 1. zamonaviy bioinformatik ma’lumotlar bazalari zamonaviy genom tadqiqotlarining o‘ziga xos belgilaridan biri bu juda katta miqdordagi ketma-ketlik ma’lumotlarini yaratishdir. genom ma’lumotlar hajmi o‘sib borishi bilan, ma’lumotlarni boshqarish uchun murakkab hisoblash metodologiyasi talab qilinadi. shunday qilib, genomika va bioinformatika oldida turgan birinchi vazifa – bu kompyuter ma’lumotlar bazalarini yaratish va ulardan foydalanish orqali keng hajmdagi ma’lumotlarni saqlash va boshqarish tashkil qiladi. biologik ma’lumotlar bazasi – bu tizimda saqlanadigan ma’lumotlarning tarkibiy qismlarini yangilash, so‘rash va yuklab olish uchun mo‘ljallangan, kompyuterlashtirilgan dasturiy ta’minot bilan bog‘langan jarayon hisoblanadi. oddiy ma’lumotlar bazasi har xil ma’lumot to‘plamini o‘z ichiga olgan bitta …

2 / 14

umotlar bazasi deb ham ataladi. ular nukleotidlar ketma-ketligi, oqsillar ketma-ketligi yoki makromolekulyar tuzilish kabi eksperimental ravishda olingan ma’lumotlar kabilar bilan to‘ldirilgan. eksperimental tadqiqot natijalari tadqiqotchilar tomonidan to‘g‘ridan-to‘g‘ri ma’lumotlar bazasiga topshiriladi va bu ma’lumotlar arxivlanib boradi. ma’lumotlar quyidagi bazalarga taqdim etiladi: · embl, genbank ncbi va ddbj-nukleotidlar ketma-ketligi, · array express archive va geo-funktsional genomik ma’lumotlar, · protein ma’lumotlari banki -pdb; uch o‘lchovli makromolekulyar tuzilmalar koordinatalari. 2. ikkilamchi ma’lumotlar bazalari: ikkilamchi ma’lumotlar bazalari dastlabki ma’lumotlarni tahlil qilish natijasida olingan ma’lumotlarni o‘z ichiga oladi. ikkilamchi ma’lumotlar bazalari ko‘pincha ko‘plab manbalardan olingan ma’lumotlarga, shu jumladan boshqa ma’lumotlar bazalariga boshlang‘ich va ikkinchi darajali ma’lumotlar bazalariga asoslanadi. ushbu bazalarga quyidagilar misol bo‘ladi: · interpro- oqsil oilalari, motivlari va domenlari, · uniprot ma’lumotlar bazasi- oqsillar to‘g‘risidagi ketma-ketlik va funktsional ma’lumotlar · ensembl-genlar o‘zgaruvchanligi, funktsiyasi, boshqarish funksiyalari to‘g‘risidagi ma’lumotlar bundan tashqari ko‘pgina ma’lumotlar manbalari ham birlamchi, ham ikkilamchi xususiyatlarga ega. masalan, uniprot peptidlarni sekvenirlash tajribalarida olingan birlamchi …

3 / 14

alari ma’lumotlar ombori vazifasini bajaradi. · ma’lumotlar bazasi ma’lumotlarni saqlash va boshqarish uchun turli xil qidirish mezonlari orqali ma’lumotni osongina olish va foydalanish imkonini beradi. · ikkilamchi ma’lumotlar bazalari so‘nggi o‘n yil ichida biologiya sohalarining ma’lumotlar kutubxonasiga aylandi va tadqiqotchilar tomonidan o‘rganilgan har qanday gen yoki gen mahsuloti to‘g‘risida juda ko‘p ma’lumot olish imkonini beradi. · ko‘plab foydalanuvchilarning bir xil ma’lumotlarda ishonchlilik darajasini oshirish va murakkab muammolar yechimini topishga yordam beradi. · ma’lumotlarni indekslash, identifikatsiyalashga imkon beradi. · xilma-xil ma’lumotlarning ko‘payishini oldini olishga yordam beradi. 2. nukleotidlar ketma-ketligi bazalari-turlari va ahamiyati. biologiya sohasi tobora ma’lumotlarga boy fanga aylanib borgan sari, katta ma’lumotlar to‘plamlarini saqlash va ular bilan aloqa qilish zarurati tug‘iladi. aniq misollarga – bu nukleotidlarning ketma-ketligi, oqsillar ketma-ketligi va rentgen kristallografiyasi, makromolekulyar nmr markazi tomonidan ishlab chiqarilgan oqsillarning 3d tarkibiy va tuzilish ma’lumotlarini o‘z ichiga oladi. nukleotidlar ketma-ketligidan tashkil topgan bunday ma’lumotlar bazalari nuklein kislotalari ketma-ketligining bazalari deb nomlanadi. …

4 / 14

si, yaponiyada joylashgan. uchalasi ham nukleotidlar ketma-ketliklarini qabul qilishadi, so‘ngra ular orasidagi optimal sinxronizatsiyaga erishish uchun har kuni yangi va yangilangan ma’lumotlarni almashadilar. ushbu uchta ma’lumotlar bazasi asl ketma-ketlik ma’lumotiga ega bo‘lganligi uchun birlamchi ma’lumotlar bazasiga birikadi -insdc va ular sequence read archive-sra bilan hamkorlik qiladi, u yuqori o‘tkazuvchanlikdagi ketma-ketliklaridan olingan ma’lumotlarni arxivlaydi. genbankning ketma-ket ma’lumotlar bazasi ochiq foydalanish, barcha ommaga ma’lum bo‘lgan nukleotidlarning izohli to‘plami va ularning proteinli tarjimalaridan iborat. ushbu ma’lumotlar bazasi nukleotidlarning ketma-ketligi bo‘yicha xalqaro ma’lumotlar bazasi –insdc bilan hamkorlik qilish doirasida milliy biotexnologiya ma’lumotlari markazi -ncbi tomonidan ishlab chiqiladi va saqlanadi. dunyo bo‘ylab laboratoriyalarda 100000 dan ortiq alohida organizmlardan ishlab chiqariladigan ketma-ketliklarni jamlaydi. genbank biologik sohalarda tadqiqotlar olib borish uchun muhim ma’lumotlar bazasiga aylandi va so‘nggi 18 yilda har ikki oyda ikki baravar ko‘payib, geometrik progressiv o‘sdi. a. embl (yevropa molekulyar biologiya laboratoriyasi). yevropa molekulyar biologiya laboratoriyasi-embl. nukleotidlarning ketma-ketligi to‘g‘risidagi ma’lumotlar bazasi – yevropa bioinformatika institutida …

5 / 14

nk yoki embl kabi birlamchi ma’lumotlar bazalarining biridan yoki ikkinchisidan ajratib olingan kichik to‘plamdir. boshqa ikkilamchi ma’lumotlar bazalari ham mavjud bo‘lib, ular hech qanday ketma-ketlikni taqdim etmaydilar, ularda ketma-ketliklarning ma’lumotlar bazalarida to‘plangan ma’lumotlar mavjud. a. omniome ma’lumotlar bazasi: omniome ma’lumotlar bazasi tigr genomik tadqiqotlar instituti tomonidan qo‘llab-quvvatlanadigan keng qamrovli mikrobial manbadir. u nafaqat har bir genom uchun o‘rganib chiqilgan ketma-ketligi va izohiga ega, balki organizmlar, taksonlar dnk molekulalarining tuzilishi, tarkibi va dnk ketma-ketligidan bashorat qilingan boshqa protein tarkibi atributlari to‘g‘risidagi ma’lumotlarga egadir. ushbu ma’lumotlar bazasiko‘p genomli izlanishlar va tahlillar ishlarini osonlashtiradi, masalan, turli xil genomlardagi oqsillar va genlarning joylashish holatini taqqoslash ishlarida qo‘llaniladi. b. flybase ma’lumotlar bazasi: konsorsium d. melanogaster meva pashshasi misolida va uning barcha genomini yuqori to‘liqlik va sifatga ko‘ra ajratib beradi. c. acedb: bu nafaqat ketma-ketlikni, balki genetik haritalar, shuningdek, c. elegans nematoda qurti haqidagi fenotipik ma’lumotlarning ham omboridir. 3. ddbj- ma’lumotlar bazasi-yaponiya dna data bank japan- …

Хотите читать дальше?

Скачайте все 14 страниц бесплатно через Telegram.

Скачать полный файл

О "zamonaviy bioinformatik ma’lumotlar bazalari"

2-mavzu: zamonaviy bioinformatik ma’lumotlar bazalari reja: 1. zamonaviy bioinformatik ma’lumotlar bazalari 2. nukleotidlar ketma-ketligi bazalari-turlari va ahamiyati. 3. ddbj- ma’lumotlar bazasi-yaponiya 4. embl-tadqiqot markazi va ma’lumotlar bazasi-yevropa 5. ncbi – ma’lumotlar bazasi -genbank-aqsh 6. insdc – nukleotidlarning ketma-ketligi bo‘yicha xalqaro ma’lumotlar bazasi tayanch iboralar: ddbj, embl, ncbi, insdc, talen, crispr, tandem, xanthomonas, domen, genom lokuslari. 1. zamonaviy bioinformatik ma’lumotlar bazalari zamonaviy genom tadqiqotlarining o‘ziga xos belgilaridan biri bu juda katta miqdordagi ketma-ketlik ma’lumotlarini yaratishdir. genom ma’lumotlar hajmi o‘sib borishi bilan, ma’lumotlarni boshqarish uchun murakkab hisoblash metodologiyasi talab qilinadi. shunday qilib...

Этот файл содержит 14 стр. в формате DOCX (1,5 МБ). Чтобы скачать "zamonaviy bioinformatik ma’lumotlar bazalari", нажмите кнопку Telegram слева.

Теги: zamonaviy bioinformatik ma’lumo… DOCX 14 стр. Бесплатная загрузка Telegram