molekulyar filogenetika

PPT 30 стр. 4,1 МБ Бесплатная загрузка

30 стр.

FaylHub.uz

Скачать через Telegram

Размер 4,1 МБ

Тип файла PPT

Страницы 30

Обновлено Дек 2025

Предварительный просмотр (5 стр.)

Прокрутите вниз 👇

1 / 30

nukleotidlar ketma – ketligini tahlilini amalga oshiruvchi dasturlar reja: molekulyar filogenetika. filogenetikaning asosiy tushunchalari. filogenetik daraxtlarning tiplari. genlarni solishtirish asosida filogenetik yaqinlikni aniqlash. filogenetik daraxtlar klassifikatsiyasi. filogenetik bog’lanishlarni aniqlash filogenetik qarindoshlikni o’rnatish zamonaviy bioinformatsion dasturlar filogenez (yun. phylon — avlod, qabila va ... genez), filogeneya — tirik organizmlar hamda ular taksonomik guruxlari: olam, tip (boʻlim), sinf, turkum (tartib), oila, avlod (turkum, urugʻ) va turlarning tarixiy taraqqiyoti. "filogenez" termini nemis olimi e. gekkel tomonidan fanga kiritilgan (1866). biologiyaning filogenez va uning qonuniyatlarini oʻrganadigan boʻlimi filogenetika deyiladi. filogenetikani tadqiq qilish evolyutsiyaning umumiy nazariyasini rivojlantirish, organizmlarning tabiiy sistemasini tuzish uchun zarur. filogenetikaning xulosalari tarixiy geologiya uchun ham juda muhim. gekkel filogenezni tadqiq qilish uchun paleontologiya, solishtirma anatomiya va embriologiya dalillarini taqqoslovchi uchlik parallelizm metodini taklif etgan. filogenetikada genetika, biokimyo, molekulyar biologiya, etologiya, biogeografiya, fiziologiya, parazitologiya dalillaridan keng foydalanilmoqda. bu dalillar turdan yuqori boʻlgan har qanday taksonlar evolyutsiyasi borishini katta aniqlik bilan tiklash imkonini …

2 / 30

ladi. shajara daraxti oʻsimlik va hayvonlarning umumiy bir ildizdan kelib chiqqanligi; turli xil formalar yerdagi hayot tarixining har xil davrlarda shoxlanish orqali asta-sekin taraqqiy etganligini aks ettiradi. organizmlar filogenetik qayta tuzilishlarining adaptiv xarakterini belgilovchi asosiy kuch tabiiy tanlanish hisoblanadi. filogenetik shajara barcha oʻzgarishlarning birlamchi negizida divergensiya va filetik evolyutsiya, soʻng esa parallelizm va konvergensiya yotadi. organizm har xil guruhlarining filogenezi bir xilda oʻrganilmagan, bu qazilma qoldiklarning har xil darajada saqlanganligi va mazkur guruxlarning qanchalik qadimiyligi bilan bogʻliq. umurtqali hayvonlar (ayniqsa, yuksak guruhlari) va yuksak oʻsimliklar filogenezi, umurtqasiz hayvonlardan esa mollyuskalar, ignaterililar, boʻgʻimoyoqlilar filogenezi nisbatan yaxshi, prokariotlar va tuban oʻsimliklar filogenezi kamroq oʻrganilgan. filogenetik daraxt organizmlar oʻrtasidagi evolyutsion aloqalarni ifodalovchi diagrammadir. filogenetik daraxtlar aniq faktlar emas, balki farazlardir. filogenetik daraxtdagi shoxlanish qonuniyati turlar yoki boshqa guruhlarning umumiy ajdoddan qanday kelib chiqqanligini koʻrsatadi filogenetik daraxtdagi turlarning umumiy ajdodi qanchalik yaqin boʻlsa, ular shunchalik yaqin qarindosh, umumiy ajdodi qanchalik uzoq boʻlsa, ular shunchalik …

3 / 30

olishingiz mumkin. filogenetik daraxtda bizni qiziqtirgan turlar yoki guruhlar daraxt shoxlari uchida joylashadi. misol uchun, quyidagi filogenetik daraxt beshta tur: a, b, c, d va e turlar orasidagi aloqalarni koʻrsatib, ular daraxt shoxlarining uchida joylashtirilgan. filogenetik daraxt shoxlarining qanday joylashgani bizning berilgan turlarning umumiy ajdoddan qanday kelib chiqqanligi haqidagi tushunchalarimizni ifodalaydi. har bir shoxlanish nuqtasi (ichki tugun deb ham ataladi) divergensiya hodisasi yoki bitta ajdodning ikki yoki undan ortiq turlarga ajralishini koʻrsatadi. har bir shoxlanish nuqtasida ushbu shoxlar uchida joylashgan barcha turlarning eng soʻnggi umumiy ajdodi joylashgan. misol uchun, a va b turlar ajralib chiqqan shoxlanish nuqtasida ushbu turlarning eng soʻnggi umumiy ajdodi keltirilgan. daraxtning pastki qismi yoki ildizi tepasidagi birinchi shoxlanish nuqtasida barcha turlarning (a, b, c, d, e) umumiy ajdodi keltirilgan. dnk tarkibidagi ma'lumotlarni o'zgartirish uchun natijada olingan ketma- ketliklarni (yoki rapd, aflp va boshqalarni) tahlil qilish uchun tayyorlash kerak - matritsa yoki alignment alignment - nukleotidlar o'rtasidagi …

4 / 30

if aloqalar (a, t) a alanin p prolin b aspartat/asparagin q glutamin c sistin r arginin d aspartat s serin e glutamat t treonin f fenilalanin u selenotsistein g glisin v valin h histidin w triptofan i izolösin y tirozin k lizin z glutamat/glutamin l leysin x har qanday m metionin * tarjima to'xtashi n asparagin - noaniq uzunlikdagi bo'shliq phylonet, ils, hgt va boshqalarni hisobga olgan holda filogenetik tarmoqlarni yaratadigan java-ga asoslangan dasturiy ta'minot to'plami. filogeniya dasturlari, ularning ba'zilari filogenetik tarmoqlarni hisoblab chiqadi. filogenetik tarmoqni rekonstruktsiya qilish, baholash, vizuallashtirish va hk. splitstree dendroskop t-rex serverida tarmoq xulosasi tcs-dnk ketma-ketliklaridan filogenetik tarmoqlar yoki statistik parsimonlik yordamida nukleotid masofalari. nettest-filogenetik tarmoqlarning xarakteristikasi. phangorn- filogenetik qayta qurish va tahlil. retikulyar evolyutsion hodisalar mavjudligida filogenetik tarmoqlarni qayta qurish/tahlil qilish uchun dasturiy vositalar to'plami, shuningdek, nasl-nasab saralashiga qaramay, turdagi daraxtlarni aniqlash phylonet asosan toʻrsimon (yoki daraxtga oʻxshamaydigan) evolyutsion munosabatlarni tahlil qilish, qayta qurish va …

5 / 30

sensus tarmoqlari, [4] super tarmoqlar usullari yoki gibridizatsiya yoki oddiy rekombinatsiya tarmoqlarini hisoblash usullari kabi nashr etilgan usullarni qo'llaydi . u nexus fayl formatidan foydalanadi . splits grafigi maxsus ma'lumotlar bloki (splits bloki) yordamida aniqlanadi. dendroskop interaktiv hisoblanadi kompyuter dasturlari yozilgan dastur java uchun ko'rish filogenetik daraxtlar.[1] ushbu dastur har xil o'lchamdagi daraxtlarni ko'rish uchun mo'ljallangan va raqamlar yaratish uchun juda foydali. bu daniel huson va uning hamkasblari tomonidan ishlab chiqilgan. dendroskop: (a) dumaloq kladogramma, (b) radial filogramma, (c) to'rtburchaklar shaklli filogramma va (d) qiya kladogramma ko’rinishlarida bo’lishi mumkin a filogenetik tarmoq har qanday grafik evolyutsion munosabatlarni tasavvur qilish uchun ishlatiladi (ham) mavhum ravishda yoki aniq)[1] o'rtasida nukleotidlar ketma-etligi, genlar, xromosomalar, genomlar, yoki turlari.[2] kabi retikulyatsiya hodisalari yuz berganda ular ishlaydi duragaylash, gorizontal genlarning uzatilishi, rekombinatsiya, yoki genlarning takrorlanishi va yo'qotish bilan bog'liq deb hisoblashadi. ular farq qiladi filogenetik daraxtlar boy bog'langan tarmoqlarni aniq modellashtirish yo'li bilan, faqat daraxt tugunlari …

Хотите читать дальше?

Скачайте все 30 страниц бесплатно через Telegram.

Скачать полный файл

О "molekulyar filogenetika"

nukleotidlar ketma – ketligini tahlilini amalga oshiruvchi dasturlar reja: molekulyar filogenetika. filogenetikaning asosiy tushunchalari. filogenetik daraxtlarning tiplari. genlarni solishtirish asosida filogenetik yaqinlikni aniqlash. filogenetik daraxtlar klassifikatsiyasi. filogenetik bog’lanishlarni aniqlash filogenetik qarindoshlikni o’rnatish zamonaviy bioinformatsion dasturlar filogenez (yun. phylon — avlod, qabila va ... genez), filogeneya — tirik organizmlar hamda ular taksonomik guruxlari: olam, tip (boʻlim), sinf, turkum (tartib), oila, avlod (turkum, urugʻ) va turlarning tarixiy taraqqiyoti. "filogenez" termini nemis olimi e. gekkel tomonidan fanga kiritilgan (1866). biologiyaning filogenez va uning qonuniyatlarini oʻrganadigan boʻlimi filogenetika deyiladi. filogenetikani tad...

Этот файл содержит 30 стр. в формате PPT (4,1 МБ). Чтобы скачать "molekulyar filogenetika", нажмите кнопку Telegram слева.

Теги: molekulyar filogenetika PPT 30 стр. Бесплатная загрузка Telegram