oqsil strukturasini oldindan aytish va o’rganish bo’yicha zamonaviy yondashuvlar

PPT 32 стр. 3,5 МБ Бесплатная загрузка

32 стр.

FaylHub.uz

Скачать через Telegram

Размер 3,5 МБ

Тип файла PPT

Страницы 32

Обновлено Дек 2025

Предварительный просмотр (5 стр.)

Прокрутите вниз 👇

1 / 32

nukleotidlar ketma – ketligini tahlilini amalga oshiruvchi dasturlar reja: oqsil strukturasini oldindan aytish va o’rganish bo’yicha zamonaviy yondashuvlar. ramachandra xaritalari. barkarorlik va oqsillar foldingi. gidrofoblik profilining taxlili. biosensor - biologik yelib chiqishga ega bo’lgan va optik yoki elektrik o’zgartirishga olib keluvchi detektordan tashkil topgan qurilma surfactant - amfifil modda bo’lib, yuzadan suyuqlik tortilishini kamaytiradi phospholipid – manfiy zaryadlangan fosfat guruhini o’zida saqlovchi lipid. hydrogel -suvdan iborat polimer zanjir kevlar -aromatik poliamidlardan tashkil topgan judayam mustahkam tolalarning bir turi kinesin - modda solingan mikrotrubkalar bo’ylab harakatlanuvchi oqsillar sinfi. lab-on-a-chip - judayam kam hajmdagi suyuqlik namunalarini (bir necha pikolitr 12 hajmli) tekshiruvchi asbob. genlarning joylashishi va tuzilishini to'g'ri bashorat qilish keyingi genom davridagi, ayniqsa eukaryotik genomlar uchun katta qiyinchiliklardir. so'nggi o'n yillikda oqsillarni kodlaydigan dnk segmentlarini topish uchun genom tizimlarini skanerlash uchun ko'plab kompyuter dasturlari ishlab chiqilgan. agar siz ushbu organizmning kodondan foydalanish usulini bilsangiz, prokaryotik genlarni aniqlik bilan taxmin qilish mumkin. …

2 / 32

am istisnolarga moyil. ba'zi genlar bir-birining ichiga joylashtirilgan (bir-birining ustiga) (dunham va boshqalar 1999). pseudogenlarning mavjudligi proteinlarni kodlash hududlarini aniqlashni yanada qiyinlashtiradi. odatda kodlash ketma-ketligining yuqorisida joylashgan tartibga soluvchi ketma-ketliklar ba'zida pastda va genlar ichida joylashgan bo'lishi mumkin. prokaryotik tizimlarda genlar oddiy tuzilishga ega bo'lib, ularda protonlar kodlaydigan hududlarni ajratib bo'lmaydi va ularni aniqlash oson. biroq, eukaryotik genomik ketma-ketlikda genlarni topish arzimas muammo emas. prokaryotik genomlardan farqli o'laroq, eukaryotlardagi kodlash hududlari eukaryotik genomning ozgina qismini tashkil qiladi va asosan ular genomning takrorlanmaydigan hududlarida joylashgan. genlarni bashorat qilishda ishlatiladigan asosiy mavjud usullar jadvalda keltirilgan. uch o'lchovli tuzilmalari va funktsional xususiyatlarining juda xilma-xilligi strukturani tashkil etishning ma'lum tamoyillariga bo'ysunadigan molekulalar asosida amalga oshiriladi. kimyoviy analogiyalarni ishlab chiqish, oqsillarni solishtirish mumkin. rojdestvo daraxti ustidagi chiroqlar gulchambarlari bilan ip: har bir oqsil chiziqli (ya'ni shoxlanmagan) polimer zanjiri bo'lib, unga ma'lum bir oraliqda aminokislotalar qoldiqlarining turli yon radikallari biriktiriladi.. chiroqlarni ulash simlari asosiy zanjir yoki …

3 / 32

mani qanday kodlaydi? asosiy zanjirning katlama variantlarining har biri aminokislota qoldiqlari o'rtasida ma'lum kontaktlarning paydo bo'lishiga olib keladi. yon radikallar va asosiy zanjirning bir-biri bilan va erituvchi bilan o'zaro ta'siri, shuningdek, yon radikallarning harakatchanligiga qo'yilgan cheklovlar turli konformatsiyalarning nisbiy barqarorligini aniqlaydi. bu termodinamikaning ikkinchi qonunining ko'rinishi bo'lib, unga ko'ra doimiy harorat va bosimdagi tizimlar muvozanat holatiga keladi, bunda energiya "komfort" (past entalpiya h) va "erkinlik" (yuqori entropiya ) o'rtasida murosaga erishiladi. minimal energiyaga olib keladi gibbs c = h - t8 (bu erda t - mutlaq harorat ). protein tuzilmalarining evolyutsiyasi shunday davom etdiki, ixtiyoriy oqsil uchun kosmosda asosiy zanjirni yotqizishning faqat bitta usuli mavjud, bu boshqa mumkin bo'lgan konformatsiyalarga qaraganda termodinamik jihatdan ancha qulaydir. bu davlat mahalliy deb ataladi. va agar biz energiya va entropiyalarni etarlicha aniq hisoblab, ularning orasidan eng yaxshisini topishga ishonch hosil qilish uchun etarlicha katta konformatsiyalar ansamblini tekshira olsak, u holda oqsilning tuzilishini faqat uning …

4 / 32

ni ham talqin qilish qiyinchiliklari ko'rsatilgan. uch xil mumkin bo'lgan o'qish freymlarini ko'rsatadigan misol ketma-ketligi. boshlang'ich kodonlar binafsha rang bilan, to'xtash kodonlari qizil rang bilan ajratilgan. molekulyar genetikada, ochiq o'qish ramkasi (orf) tarjima qilinishi mumkin bo'lgan o'qish doirasining bir qismidir. ruf boshlang'ich kodondan (odatda aug) boshlanadi va to'xtash kodonida (odatda uaa, uag yoki uga) tugaydigan kodonlarning doimiy qismidir. orf ichidagi atg kodon (rnk shaklidagi aug) (shart emas birinchi) tarjima qayerda boshlanishini ko'rsatishi mumkin. transkriptni bekor qilish joyi orfdan keyin, tarjima to'xtash kodonidan tashqarida joylashgan. agar transkodatsiya to'xtash kodonidan oldin to'xtasa, tarjima paytida to'liq bo'lmagan protein olinadi. vaukaryotik sharoitda oqsillarni tarjima qilish uchun yakuniy mrnkni ishlab chiqarish uchun transkripsiyadan so'ng bir nechta ekzon, intron bilan genlar chiqariladi va ularning o'zaro aloqasi bor. shunday qilib, genlarni qidirish kontekstida orf ni boshlang'ich holatini aniqlash faqat genom dnkga emas, balki splikalangan mrnk-larga nisbatan qo'llaniladi, chunki intronlarda to'xtash kodonlari bo'lishi mumkin va / yoki o'qish …

5 / 32

nishini anglatmaydi. masalan, har bir nukleotidning teng foizli tasodifiy hosil bo'lgan dnk ketma-ketligida, 21 ta kodondan bir marta to'xtash kodoni kutilishi mumkin. prokaryotlarning oddiy genlarini aniqlash algoritmi original kodonni izlashi mumkin, so'ngra odatdagi oqsilni kodlash uchun etarli bo'lgan ochiq o'qish doirasi mavjud. bu mintaqaning kodonidan foydalanish ma'lum bir organizmning kodlash mintaqalari uchun chastota javobiga mos keladigan joyda. shu sababli, ba'zi mualliflarning ta'kidlashicha, ruf minimal uzunlikka ega bo'lishi kerak, masalan 100 kodon yoki 150 kodon. o'z-o'zidan, hatto ochiq o'qish doirasi ham ma'lum bir gen mavjudligini ishonchli dalil emas. boshqa tomondan, oqsilni kodlovchi genlarning klassik xususiyatlariga ega bo'lmagan (ncrna kabi) ba'zi qisqa orflar (sorf) isbotlangan mrna dan), funktsional peptidlarni ishlab chiqarishi mumkin. ma'lumki, sutemizuvchi mrnkning taxminan 50% ning 5'ntr bir yoki bir nechta sorflardan iborat. sinflarni tarjima qilishni boshlash uchun eksperimental ravishda topilgan saytlarning 64-75 foizi odam va sichqonlar genomlarida saqlanadi va bu elementlar funktsiyaga ega ekanligini ko'rsatishi mumkin. ammo, yaralar ko'pincha …

Хотите читать дальше?

Скачайте все 32 страниц бесплатно через Telegram.

Скачать полный файл

О "oqsil strukturasini oldindan aytish va o’rganish bo’yicha zamonaviy yondashuvlar"

nukleotidlar ketma – ketligini tahlilini amalga oshiruvchi dasturlar reja: oqsil strukturasini oldindan aytish va o’rganish bo’yicha zamonaviy yondashuvlar. ramachandra xaritalari. barkarorlik va oqsillar foldingi. gidrofoblik profilining taxlili. biosensor - biologik yelib chiqishga ega bo’lgan va optik yoki elektrik o’zgartirishga olib keluvchi detektordan tashkil topgan qurilma surfactant - amfifil modda bo’lib, yuzadan suyuqlik tortilishini kamaytiradi phospholipid – manfiy zaryadlangan fosfat guruhini o’zida saqlovchi lipid. hydrogel -suvdan iborat polimer zanjir kevlar -aromatik poliamidlardan tashkil topgan judayam mustahkam tolalarning bir turi kinesin - modda solingan mikrotrubkalar bo’ylab harakatlanuvchi oqsillar sinfi. lab-on-a-chip - judayam kam hajmdagi suyuqlik namunalarini ...

Этот файл содержит 32 стр. в формате PPT (3,5 МБ). Чтобы скачать "oqsil strukturasini oldindan aytish va o’rganish bo’yicha zamonaviy yondashuvlar", нажмите кнопку Telegram слева.

Теги: oqsil strukturasini oldindan ay… PPT 32 стр. Бесплатная загрузка Telegram