biologik makromolekulalarni vizualizatsiyalashning zamonaviy usullari

PPT 31 стр. 3,7 МБ Бесплатная загрузка

Предварительный просмотр (5 стр.)

Прокрутите вниз 👇
1 / 31
слайд 1 biologik makromolekulalarni vizualizatsiyalashning zamonaviy usullari reja: 1. oqsil strukturalari 2. ligant bog’lovchi saytlar 3. rnk strukturalari 4. molekulalar harakati 5. yirik makromolekulalar kompleksi biologik makromalekulalar oqsillar yog’lar uglevodlar oqsillar haqida umumiy tushuncha oqsillar tarkibida azot tutuvchi yuqori molekulali birikmalar bo’lib, hayotiy jarayonlarda, hujayraning tuzilishida alohida ahamiyat kasb etadi. hozirgacha oqsillarning 60 000 dan ortiq turlari o’rganilgan. e.coli 3000 odam organizmida 5000 000 ga yaqin – undan 2000 ga yaqini kashf etilgan va yaxshi organilgan. oqsillar organizmdagi quyidagi muhim funksiyalarni bajaradi: 1. katalitik; 2. zahira ozuqa moddasi sifatida; 3. transport; 4. immunologik vazifa; 5. qisqarish vazifasi; 6. oqsil garmonlar; 7. strukturaviy vazifa. oqsillarning strukturalarini aniqlashda bir qancha metodlardan foydalaniladi. oqsillarning soddalashtirilgan 3d strukturalari worldwide protein data bank (pdb), rscb pdb, pdb europe, pdb japan. * oqsillarning 3 d strukturalarini aniqlash uchun quyidagilarni bilishimiz kerak: 1. domen 2. snp 3. oqsillarni bog’lovchi birliklar oqsillar o’rtasida: 1. oqsil yuzasi va zanjir …
2 / 31
lani o’z ichiga oluvchi 37 000 dan ortiq bog’lovchi saytlar haqida ma’lumotlar saqlanadi. shu saytlarni vizualizatsiya qilish uchun bir qator metodlar yaratilmoqda. minglab kilometrli sayohat dastlabki birgina qadamdan boshlangani kabi hujayra ichidagi murakkab signal oʻtkazuvchi yoʻllar ham birgina muhim hodisa – signal molekulasi yoki ligandning qabul qiluvchi molekula yoki retseptorga bogʻlanishi bilan boshlanadi. retseptor va ligandlar turli shakllarda boʻlishi mumkin, ammo ularda birgina umumiylik mavjud: retseptor bir (yoki bir nechta) muayyan ligandlarni tanib hamda ligand bir (yoki bir nechta) nishon retseptorlarga bogʻlanib, juft hosil qiladi. ligandning retseptorga bogʻlanishi natijasida retseptorning shakli yoki harakat tarzi oʻzgaradi, bu esa oʻz navbatida signalni uzatishga yoki toʻgʻridan toʻgʻri hujayra ichida oʻzgarishlar roʻy berishiga yoʻl ochadi. retseptor turlari hujayra ichkarisida (sitoplazmada yoki yadroda) uchrovchi hujayra ichi retseptorlari. plazmatik membranada uchrovchi hujayra yuzasi retseptorlari. hujayra ichi retseptorlari hujayra ichi retseptorlari retseptor oqsillar boʻlib, ular hujayra ichida asosan sitoplazma va yadroda joylashadi. ligandlar hujayra ichida joylashgan retseptoriga …
3 / 31
, yaʼni retseptor dnkning muayyan ketma-ketligiga bogʻlanishi mumkin boʻladi. bu kabi muayyan ketma-ketliklar hujayra dnksining maʼlum bir genlari yaqinida joylashgan boʻladi va retseptorning shu genlar yaqiniga bogʻlanishi genning transkripsiya darajasini oʻzgartiradi. active site site environment ligandlar va ligandlarga eng yaqin turgan uchastkalar oqsilning boshqa qismiga nisbatan yaqqol o’rganiladi. aniqlangan ligandni qanday kichik molekula bilan bog’lana olishini aniqlash. bunda 3 yondashuvga asoslanadi: 1. yuzaga asoslangan yondashuv – yuza qismning ranglari orqali molekulaning kimyoviy xususiyatlari o’rganiladi. 2. o’lchamga asoslangan yondashuv – nishon molekulasi atrofidagi bo’shliq, yoki hajm o’rganiladi va kichik molekulalar bilan kuchli ta’sirlasha olishi mumkin bo’lgan uchastkalar ajratib olinadi. (autoligand dasturi yardamida) 3. ketma-ketlikka asoslangan yondashuv. uchlamchi struktura solishtirilganda olingan ko’plik taqqoslash natijalari o’rganiladi va shu ketma-ketliklardagi bog’lovchi sayt ketma-ketligiga eng ko’p mos keladiganlari tanlab olinadi. bu yondashuv asosan o’rganilayotgan oqsil haqida ma’lumot yetarli bo’lmaganda ishlatiladi. (tracesuite, etv) ko’p sonli ligandlar -bitta oqsil bir necha xil ligantga ega bo’lib, har-xil strukturalarni …
4 / 31
an bog’lar: vodorod bog’lar; elektrostatik bog’lar; van der-vaals bog’lari. (ligplot, poseview) rnk strukturasi ndb ma’lumotlar ba’zasida 40 000 dan ortiq nuklein kislotalarning uchlamchi strukturasi haqida ma’lumotlar saqlanadi. rnk strukturasini ko’plik solishtirish orqali 2 ta nukleotid o’rtasida hosil bo’luvchi bog’larni aniqlash va rnkni ikkilamchi strukturasini solishtirish imkonini beradi. molekulalar harakati biomakromolekulalar dinamik harakatchan va bu harakat ko’pincha funksiya bajarishi mumkin. oqsil funksiyasini amalga oshirishi mumkin. ya’ni biolagik makromolekulalar bir ko’rinishdan ikkinchisiga tez va oson o’tishini molekulalar harakati ta’minlaydi. yale morph server, moviemaker vizualizatsiya dasturlari molekulalarni mavjud bo’lgan ikkita holati o’rtasidagi dinamik harakatini o’rganishda qo’llaniladi. molekulalar harakati yirik makromolekulalar kompleksi biologiyada yamr, lazerli konfokal mikroskopiya, rentgenostrukturaviy analiz elektroon mikroskopiya, hatto yorug’lik mikroskopi metodlarining borligi yirik makromolekulalarni vizualizatsiyalashda qiyinchilik tug’dirmaydi. e’tiboringiz uchun raxmat!!! john liebler - kinesin walking
5 / 31
biologik makromolekulalarni vizualizatsiyalashning zamonaviy usullari - Page 5

Хотите читать дальше?

Скачайте все 31 страниц бесплатно через Telegram.

Скачать полный файл

О "biologik makromolekulalarni vizualizatsiyalashning zamonaviy usullari"

слайд 1 biologik makromolekulalarni vizualizatsiyalashning zamonaviy usullari reja: 1. oqsil strukturalari 2. ligant bog’lovchi saytlar 3. rnk strukturalari 4. molekulalar harakati 5. yirik makromolekulalar kompleksi biologik makromalekulalar oqsillar yog’lar uglevodlar oqsillar haqida umumiy tushuncha oqsillar tarkibida azot tutuvchi yuqori molekulali birikmalar bo’lib, hayotiy jarayonlarda, hujayraning tuzilishida alohida ahamiyat kasb etadi. hozirgacha oqsillarning 60 000 dan ortiq turlari o’rganilgan. e.coli 3000 odam organizmida 5000 000 ga yaqin – undan 2000 ga yaqini kashf etilgan va yaxshi organilgan. oqsillar organizmdagi quyidagi muhim funksiyalarni bajaradi: 1. katalitik; 2. zahira ozuqa moddasi sifatida; 3. transport; 4. immunologik vazifa; 5. qisqarish vazifasi; 6. oqsil garmo...

Этот файл содержит 31 стр. в формате PPT (3,7 МБ). Чтобы скачать "biologik makromolekulalarni vizualizatsiyalashning zamonaviy usullari", нажмите кнопку Telegram слева.

Теги: biologik makromolekulalarni viz… PPT 31 стр. Бесплатная загрузка Telegram