transkriptomika usullari yordamida genlar ekspressiyasini miqdoriy aniqlash

PPTX 20 стр. 721,2 КБ Бесплатная загрузка

Предварительный просмотр (5 стр.)

Прокрутите вниз 👇
1 / 20
powerpoint presentation transkriptomika usullari yordamida genlar ekspressiyasini miqdoriy aniqlash ismoiljonova ruhshona 1. transkriptomika usullarining asosiy tushunchalari 2. gen ekspressiyasini miqdoriy aniqlash usullari 3. ma'lumotlar tahlili va talqini reja: kvantitativ real-time pcr (qrt-pcr) relativ kvantifikasion usulida qrt-pcr orqali ma'lum bir genning ekspression darajasini referent gen ekspressioniga nisbatan 2-δδct formula orqali hisoblash mumkin. qrt-pcrda fluorescent bo'yoqlardan foydalanib, amplituda signalining o'zgarishi orqali maqsadli dnkning miqdorini aniq va sezgir tarzda o'lchash mumkin. tadqiqot natijalari va xulosalar o'rganilgan 15 ta genning ekspression darajasi rna-seq ma'lumotlari tahlili natijasida 2-3 baravar o'zgarib, differensial ekspression aniqlandi. mikroarray tahlili natijasida 1000 dan ortiq genning ekspression darajasining o'zgarishi aniqlanib, ularning funktsional boyligi go tahlili yordamida tasvirlangan. gen ekspressioni nima? odam genomida taxminan 20 000 dan ortiq gen mavjud bo'lib, har bir hujayra turli vaqt va sharoitlarda ushbu genlarning faqat bir qismini ifodalaydi. gen ekspressioni hujayraning dnksidagi genetik ma'lumotlaridan foydalanib, oqsil yoki rnkni ishlab chiqarish darajasini bildiradi, bu jarayon transkripsiya va …
2 / 20
i va p-qiymati 0.05 dan kam bo'lgan genlar differensial ekspression qilingan deb hisoblanadi. rnk-seq texnologiyasi rnk-seq texnologiyasi millionlab rnk molekulalarini ketma-ketlikka joylashtirib, transkriptlarning nisbiy miqdorini aniqlaydi va shu orqali gen ekspressionini keng qamrovli tahlil qilish imkonini beradi. rnk-seq texnologiyasi, differensial ekspression tahlili kabi statistik usullar bilan birgalikda, 0,05 dan kam p-qiymati bilan yuqori aniqlikdagi natijalar beradi. taqdirlash va normalizatsiya usullari taqdirlashda rpkm (reads per kilobase million) kabi usullar transkript uzunligini hisobga olib, millionta o'qishdagi har bir genning transkript miqdorini aniqlaydi, bu nisbiy ifodani ta'minlaydi. normalizatsiya uchun tmm (trimmed mean of m-values) usuli, gen ifodasining o'zgaruvchanligini hisobga olgan holda, namunalar o'rtasidagi umumiy o'qish sonini hisobga oladi va 10000 ga yaqin genlarni tahlil qilish uchun mos keladi. yo'l boyitish tahlili mikroray (mikroarray) tahlili 20 000 dan ortiq genlarning ifodalanishini bir vaqtning o'zida o'lchashga imkon beradi va bu natijalar differentsial gen ekspressionini aniqlashga yordam beradi. gen ekspressionining miqdoriy aniqlanishida rnk ketma-ketligini aniqlash texnologiyalari …
3 / 20
gen ekspressionining turli jihatlarini aks ettirib, transkriptomik tahlilda hujayra funksiyalarini tushunishga yordam beradi. keyinchalik avlod ketma-ketliklari (ngs) ngs yordamida olingan katta hajmdagi ma'lumotlar (gigabaytlar miqdorida) bioinformatika vositalari yordamida tahlil qilinadi va bu gen ekspressionining statistik jihatdan ahamiyatli farqlarini aniqlashga yordam beradi, masalan, p 6 hujayrada nechta rnk molekulasi borligini aniqlashga yordam beradi. ma'lumotlarning ishonchliligiga erishish uchun har bir namunada uch martadan kam bo'lmagan takrorlash o'tkazish va p<0.05 chegarasidan foydalanib statistik tahlil qilish kerak. transkriptomika tadqiqotlarining qo'llanilishi транскриптомика ёрдамида 1000 дан ортиқ геннинг ифодасини бир вақтнинг ўзида ўлчаш ва таҳлил қилиш имкониятини беради, бу эса касалликнинг патогенезини тушунишда муҳим аҳамиятга эга. микрорнкларнинг ген экспрессиясига таъсирини ўрганишда квантификация қилинган транскриптомика маълумотларидан фойдаланиш орқали 500 дан ортиқ микрорнкнинг таъсирини аниқлаш мумкин. mikroarray texnologiyasi днк микромассивларининг аниқлиги 90% дан юқори бўлиши мумкин, аммо бу натижаларни талқин қилишда экспериментал хатоларни ҳисобга олиш муҳимдир. микромассивлардаги нуклеотидларнинг гибридизацияси сигналининг кучи геннинг экспрессия даражаси билан тўғридан-тўғри мутаносиб бўлиб, …
4 / 20
pg image9.jpg image10.jpg image11.jpg image12.jpg image13.jpg image14.jpg image15.jpg image16.jpg image17.jpg
5 / 20
transkriptomika usullari yordamida genlar ekspressiyasini miqdoriy aniqlash - Page 5

Хотите читать дальше?

Скачайте все 20 страниц бесплатно через Telegram.

Скачать полный файл

О "transkriptomika usullari yordamida genlar ekspressiyasini miqdoriy aniqlash"

powerpoint presentation transkriptomika usullari yordamida genlar ekspressiyasini miqdoriy aniqlash ismoiljonova ruhshona 1. transkriptomika usullarining asosiy tushunchalari 2. gen ekspressiyasini miqdoriy aniqlash usullari 3. ma'lumotlar tahlili va talqini reja: kvantitativ real-time pcr (qrt-pcr) relativ kvantifikasion usulida qrt-pcr orqali ma'lum bir genning ekspression darajasini referent gen ekspressioniga nisbatan 2-δδct formula orqali hisoblash mumkin. qrt-pcrda fluorescent bo'yoqlardan foydalanib, amplituda signalining o'zgarishi orqali maqsadli dnkning miqdorini aniq va sezgir tarzda o'lchash mumkin. tadqiqot natijalari va xulosalar o'rganilgan 15 ta genning ekspression darajasi rna-seq ma'lumotlari tahlili natijasida 2-3 baravar o'zgarib, differensial ekspression aniqlandi. mik...

Этот файл содержит 20 стр. в формате PPTX (721,2 КБ). Чтобы скачать "transkriptomika usullari yordamida genlar ekspressiyasini miqdoriy aniqlash", нажмите кнопку Telegram слева.

Теги: transkriptomika usullari yordam… PPTX 20 стр. Бесплатная загрузка Telegram