molekular filgenetika

DOCX 10 pages 351.7 KB Free download

10 pages

FaylHub.uz

Download via Telegram

Size 351.7 KB

File type DOCX

Pages 10

Updated Dec 2025

Page preview (5 pages)

Scroll down 👇

1 / 10

v mavzu. molekular filgenetika 1. filogenetikaning asosiy tushunchalari. 0. molekulyar biologiya bo'yicha ma'lumotlar. har bir organizmning axborot arxivi (genomi) ushbu shaxsning kelajakdagi rivojlanishi va faoliyatining batafsil rejasini o'z ichiga oladi. dnk molekulalari uzun, chiziqli, zanjirli molekulalar bo'lib, ular to'rt harfli alifboda yozilgan zanjirlardir (1-rasm). a b 5.1-rasm. dnk tuzilish diagrammasi: a - van der vaals modeli, b - dnkdagi kimyoviy bog'lanish diagrammasi hatto mikroorganizmlarning genomlari ham juda uzun iplar bo'lib, odatda millionlab harflardan iborat. har qanday nuklein kislotani belgilar qatori sifatida yozishda nukleotidlarni inglizcha kichik harflar bilan tasvirlash odatiy holdir: a - adenin, g - guanin, c - sitozin, t - timin va - urasil. dnkning tuzilishi replikatsiya va ma'lumotni gendan oqsilga o'tkazish mexanizmlarini to'liq belgilaydi. mukammalga yaqin replikatsiya irsiyatning barqarorligi uchun zarurdir. replikatsiyada biroz noaniqlik, shuningdek, begona genetik materialni import qilish mexanizmi ham zarur, aks holda jinsiy reproduktsiyaga ega bo'lmagan organizmlar rivojlana olmaydi. ikki tomonlama spiralning zanjirlari antiparalleldir. uchlari …

2 / 10

lgilarini katta lotin harflari bilan quyidagicha ishlatamiz: polar bo'lmagan aminokislotalar: masalan, (glu)r - arginin (arg). yoki jadvalga qarang. 0. genetik kod genetik kod shifrdir: dnk ketma-ketligidagi uchlik harflar aminokislotalarni ifodalaydi (5.1-jadval). 5.1-jadval. standart genetik kod proteinlarning aminokislotalar ketma-ketligi dnk bo'limlarida kodlangan. odatda, oqsillar uzunligi 200-400 aminokislotadan iborat bo'lib, ularni kodlash uchun dnkning 600-1200 nukleotidini talab qiladi. rnk molekulalarining sintezi, masalan, ribosomalarning rnk komponentlari ham dnkdagi nukleotidlar ketma-ketligi bilan belgilanadi. biroq, ko'pchilik organizmlarda rnk yoki oqsillar uchun barcha dnk kodlari mavjud emas. dnk ketma-ketligining ba'zi bo'limlari transkripsiya va replikatsiya jarayonlarini boshqarish uchun mavjud va genomning aksariyati hali ham o'rganilmagan va uning funktsiyalari hali ma'lum emas. standart to'rtta "nukleotid" harfini (a, c, g, t) o'z ichiga olgan dnk molekulalari kimyoviy tuzilishga o'xshash va dnk molekulasining fazoviy tuzilishi birinchi yaqinlashuvda bir hildir. proteinlar, aksincha, turli xil uch o'lchovli konformatsiyalar bilan tavsiflanadi. bu konformatsiyalar oqsillarning turli strukturaviy va funksional rollarini bajarishi uchun zarurdir. proteindagi …

3 / 10

chinchi tuzilishiga ega bo'ladilar, bu tabiiy kelib chiqishi mahalliy tuzilishidan farq qilmaydi. oqsillarning o'z-o'zidan katlanmasi - buklanishi - ularning tabiiy tuzilishini shakllantirish uchun tabiat bir o'lchovli genetik va peptid ketma-ketliklaridan barchamiz yashayotgan uch o'lchovli dunyoga ulkan sakrashni amalga oshiradigan nuqtadir. biroq, quyidagi paradoks mavjud. bir tomondan, dnk ketma-ketligini aminokislotalar ketma-ketligiga tarjima qilishni mantiqiy ravishda tasvirlash juda oson - bu genetik kod bilan belgilanadi. va polipeptid zanjirining aniq belgilangan uch o'lchovli tuzilishga katlanishini mantiqiy ta'riflash juda qiyin. boshqa tomondan, translatsiyani amalga oshirish uchun ribosoma, transfer rnk (trnk) va ular bilan bog'liq molekulalar ishlashning o'ta murakkab mexanizmi talab qilinadi. va oqsillarning katlanması tashqi yordamisiz o'z-o'zidan sodir bo'ladi. proteinlarning vazifalari ularning mahalliy uchinchi tuzilishga ega bo'lishiga bog'liq. masalan, fermentning mahalliy tuzilishi uning yuzasida bir kichik substrat molekulasini bog'laydigan va uni katalitik markazning aminokislota qoldiqlari yoniga joylashtirgan tushkunlikka (faol markaz) ega bo'lishi mumkin. shunday qilib, bizda quyidagi ma'lumotlarga asoslangan bog'liqliklar mavjud: · dnkning nukleotidlar …

4 / 10

g transformatsiyasini katalizlovchi fermentning mahsuldorligini oshirishga olib kelishining molekulyar mexanizmlarini tushunish oson. organizmning hayoti davomida rivojlanishi uchun dasturlar yanada murakkabroq. axborot oqimi va tanadagi ushbu oqimning tartibga solinishi haqidagi ushbu fundamental savollar endi bioinformatika usullari bilan faol o'rganila boshlandi. 1. kompyuter dasturi clustal va boshqa dasturlar. clustal (inglizcha cluster al ignment ) nukleotidlar va aminokislotalar ketma-ketligini bir nechta tekislash uchun eng keng tarqalgan kompyuter dasturlaridan biridir . dastur uchta versiyada taqdim etilgan: · clustalw - buyruq qatori interfeysi bilan [ 2 ]. · clustalx - grafik interfeys bilan [ 3 ]. · clustal omega bir necha soat ichida yuzlab ketma-ketliklarni tekislashi mumkin bo'lgan dasturning yanada zamonaviy versiyasi bo'lib, ishlash testlarida bir nechta tekislash uchun eng samarali dasturlardan biridir ^]. ushbu variant faqat buyruq qatori interfeysidan foydalanadi. asosiy bioinformatika dasturlari · act (artemis solishtirish vositasi) - genomik tahlil · arlekin - populyatsiya genetik ma'lumotlarini tahlil qilish · bioedit - nukleotidlar va …

5 / 10

va aminokislotalar ketma-ketligini ko'p taqqoslash. clustalw ga qaraganda tezroq va aniqroq · paup - parsimoniya (va boshqa usullar) yordamida filogenetik tahlil · phylip - filogenetik dasturiy ta'minot to'plami · phylo_win - filogenetik tahlil. dastur grafik interfeysga ega. · popgene - populyatsiyalarning genetik xilma-xilligini tahlil qilish · populyatsiyalar - populyatsiya genetik tahlili · psi protein klassifikatori - psi-blast dasturi yordamida olingan natijalarning qisqacha mazmuni · dengiz manzarasi - filogenetik tahlil (gui) · payet - sequence escrow genbank, embl , ddbj da · spades - bakterial genom assembler · ajratilgan daraxt · t-qahva - nukleotidlar va aminokislotalar ketma-ketligini ko'p progressiv moslashtirish. clustalw /clustalx ga qaraganda sezgirroq. · ugene - bu rus tilidagi bepul vosita, nukleotidlar va aminokislotalar ketma-ketligini bir nechta tekislash, filogenetik tahlil, annotatsiya, ma'lumotlar bazalari bilan ishlash. • velvet - genom assembler. nazorat savollari va topshiriqlari. 1. tananing axborot arxivi nima? 1. dnk molekulalari nima? 1. genetik kod nima? 1. ona …

Want to read more?

Download all 10 pages for free via Telegram.

Download full file

About "molekular filgenetika"

v mavzu. molekular filgenetika 1. filogenetikaning asosiy tushunchalari. 0. molekulyar biologiya bo'yicha ma'lumotlar. har bir organizmning axborot arxivi (genomi) ushbu shaxsning kelajakdagi rivojlanishi va faoliyatining batafsil rejasini o'z ichiga oladi. dnk molekulalari uzun, chiziqli, zanjirli molekulalar bo'lib, ular to'rt harfli alifboda yozilgan zanjirlardir (1-rasm). a b 5.1-rasm. dnk tuzilish diagrammasi: a - van der vaals modeli, b - dnkdagi kimyoviy bog'lanish diagrammasi hatto mikroorganizmlarning genomlari ham juda uzun iplar bo'lib, odatda millionlab harflardan iborat. har qanday nuklein kislotani belgilar qatori sifatida yozishda nukleotidlarni inglizcha kichik harflar bilan tasvirlash odatiy holdir: a - adenin, g - guanin, c - sitozin, t - timin va - urasil. dnkning tuzili...

This file contains 10 pages in DOCX format (351.7 KB). To download "molekular filgenetika", click the Telegram button on the left.

Tags: molekular filgenetika DOCX 10 pages Free download Telegram