biyoinformatikaga oid atamalar va tushunchalar

PPTX 16 стр. 1,1 МБ Бесплатная загрузка

16 стр.

FaylHub.uz

Скачать через Telegram

Размер 1,1 МБ

Тип файла PPTX

Страницы 16

Обновлено Дек 2025

Предварительный просмотр (5 стр.)

Прокрутите вниз 👇

1 / 16

бионформатикага оид атамалар ва тушунчалар бионформатикага оид атамалар ва тушунчалар доц. душанова г.а. zamonaviy bioinformatik ma’lumotlar bazalari. zamonaviy genom tadqiqotlarining o’ziga xos belgilaridan biri bu juda katta miqdordagi ketma-ketlik ma’lumotlarini yaratishdir. genomik ma’lumotlar hajmi o’sib borishi bilan, ma’lumotlarni o’chirilishini boshqarish uchun murakkab hisoblash metodologiyasi talab qilinadi. shunday qilib, genomika davridagi birinchi vazifa - bu kompyuter ma’lumotlar bazalarini yaratish va ulardan foydalanish orqali ajoyib hajmdagi ma’lumotni saqlash va boshqarish xisoblanadi. biologik ma’lumotlar bazasi - bu tizimda saqlanadigan ma’lumotlarning tarkibiy qismlarini yangilash, so’rash va olish uchun mo’ljallangan, kompyuterlashtirilgan dasturiy ta’minot bilan bog’langan, doimiy, ma’lumotlarning katta, ulushgan bir qismi. oddiy ma’lumotlar bazasi har xil ma’lumot to’plamini o’z ichiga olgan ko’plab yozuvlarni o’z ichiga olgan bitta fayl bo’lishi mumkin. ma’lumotlar bazasini rivojlantirishning asosiy maqsadi ma’lumotlarni oson qidirib topishga imkon beradigan tuzilgan yozuvlar to’plamida ma’lumotlarni tashkil qilishdir. biologik ma’lumotlar bazalarining turlari. ularning tarkibiga qarab biologik ma’lumotlar bazalarini taxminan ikki toifaga bo’lish mumkin: 1. birlamchi ma’lumotlar …

2 / 16

ma’lumotlar bazalari: ikkilamchi ma’lumotlar bazalari dastlabki ma’lumotlarni tahlil qilish natijasida olingan ma’lumotlarni o’z ichiga oladi. ikkilamchi ma’lumotlar bazalari ko’pincha ko’plab manbalardan olingan ma’lumotlarga, shu jumladan boshqa ma’lumotlar bazalariga (boshlang’ich va ikkinchi darajali), boshqariladigan so’z birikmalariga va ilmiy adabiyotlarga asoslanadi. ko’pincha fanning ommaviy yozuvlaridan yangi bilimlarni olish uchun hisoblash algoritmlari va qo’lda tahlil qilish hamda talqin qilishning murakkab kombinatsiyasidan foydalanib fanni yuqori darajaga ko’taradi. ushbu bazalarga quyidagilar misol bo’ladi:  interpro (oqsil oilalari, motivlari va domenlari),  uniprot ma’lumotlar bazasi (oqsillar to’g’risidagi ketma-ketlik va funktsional ma’lumotlar),  ensembl (o’zgaruvchanlik, funktsiya, tartibga solish va butun genom ketma-ketliklariga joylashtirilgan). ma’lumotlar bazalarining ahamiyati ilm fanning rivojlanishidagi o’rni juda ham muhim.  ma’lumotlar bazalari ma’lumotlar ombori vazifasini bajaradi.  ma’lumotlar bazasi ma’lumotlarni saqlash va tartibga solish uchun turli xil qidirish mezonlari orqali ma’lumotni osongina olish va foydalanish imkonini beradi.  ikkilamchi ma’lumotlar bazalari so’nggi o’n yil ichida biologiya sohalarining ma’lumotnomalar kutubxonasiga aylandi va tadqiqotchilar tomonidan …

3 / 16

alari ketma-ketligining bazalari deb nomlanadi. nukleotid ma’lumotlar bazasi genbanklar, refseq, tpa va pdb kabi bir nechta bazalar to’plamidir. genom, gen va transkripsiya ketma-ketligi ma’lumotlari biotibbiy tadqiqotlar va kashfiyot uchun asos bo’lib xizmat qiladi. a. genbank. genbankning ketma-ket ma’lumotlar bazasi ochiq foydalanish, barcha ommaga ma’lum bo’lgan nukleotidlarning izohli to’plami va ularning proteinli tarjimalari. ushbu ma’lumotlar bazasi nukleotidlarning ketma-ketligi bo’yicha xalqaro ma’lumotlar bazasi –insdc bilan hamkorlik qilish doirasida milliy biotexnologiya ma’lumotlari markazi -ncbi tomonidan ishlab chiqiladi va saqlanadi. dunyo bo’ylab laboratoriyalarda 100000 dan ortiq alohida organizmlardan ishlab chiqariladigan ketma-ketliklarni jamlaydi. genbank biologik sohalarda tadqiqotlar olib borish uchun muhim ma’lumotlar bazasiga aylandi va so’nggi 18 yilda har ikki oyda ikki baravar ko’payib, geometrik progressiv o’sdi. b. embl (yevropa molekulyar biologiya laboratoriyasi). yevropa molekulyar biologiya laboratoriyasi-embl. nukleotidlarning ketma-ketligi to’g’risidagi ma’lumotlar bazasi - yevropa bioinformatika institutida -ebi saqlanadigan birlamchi nukleotidlarning ketma-ket to’plamini saqlaydi. ma’lumotlarni genomlarni sekvenslash markazlaridan, alohida olimlardan va patent idoralaridan oladi. c. ddbj-yaponiya …

4 / 16

‘naqshlari, ularning dnk molekulalarining tuzilishi va tarkibi va boshqa protein tarkibidagi atributlar to’g’risida ham ma’lumotlarga ega. dnk ketma-ketligidan bashorat qilingan. bu ko’p genomli izlanishlar va tahlillarni osonlashtiradi, masalan, butun genlarni moslashtirish va turli xil genomlardagi oqsillar va genlarning jismoniy holatini taqqoslash va hk. b. flybase ma’lumotlar bazasi: konsorsium d. melanogaster meva pashshasi misolida va uning barcha genomini yuqori to’liqlik va sifatga ko’ra ajratib beradi c. acedb: bu nafaqat ketma-ketlikni, balki genetik xaritani, shuningdek, c. elegans nematoda qurti haqidagi fenotipik ma’lumotlarning ham omboridir . ddbj-ma’lumotlar bazasi -yaponiya dna data bank japan)-yaponiya dnk ma’lumotlar bazasi bo’lib, turli genlar va organizmlar bilan bog’liq nukleotid ketma-ketliklar haqida ma’lumotga ega bo’lgan elektron resurslar bazasidir (2-rasm). ddbj markazi insdc a’zosi sifatida nukleotid natija ma’lumotlarini to’playdi (xalqaro nukleotid natija bazasi hamkorligida). ddbj ma’lumotlar bazasinig tashkillashtirilishi:  1980 embl ma’lumotlar kutubxonasi tashkil etildi, va yaponiyaga nukleotid natija ma’lumotlar banki uchun xalqaro hamkorlikni so’radi.  1982 embl va genbank …

5 / 16

azi va ma’lumotlar bazasi- yyevropa. embl-tadqiqot markazi va ma’lumotlar bazasi haqida umumiy ma’lumot. embl -1974 yilda tashkil topgan, hayot haqidagi fanlar bo ’yicha yyevropaning yetakchi laboratoriyalari-molekulyar biologiya spetrlarini qamrab oluvchi 80 dan ortiq mustaqil tadqiqot guruhlari bo’lgan hukumatlararo tashkilot (1-rasm). embl- tadqiqot markazi va ma’lumotlar bazasi oltita saytlar hamjihatligida ishlaydi: heidelberg, barselona, gamburg, grenobl, rim va embl-ebi xinxton. yyevropa molekulyar biologiya laboratoriyasi –embl dunyodagi yetakchi ilmiy-tadqiqot institutlari va yyevropaning hayot haqidagi ilm-fan laboratoriyalari jamlanmalaridan biridir. embl yyevropa bo’ylab oltita markaz va uning saytlardan foydalanib ishlaydi: 1. heidelberg, germaniya* - asosiy laboratoriya; 2. xinxton, buyuk britaniya* - yyevropa bioinformatika instituti (embl-ebi); 3. grenobl, fransiya* - tarkibiy biologiya bo’yicha tadqiqotlar va xizmatlar; 4. gamburg, germaniya* - tarkibiy biologiya bo’yicha tadqiqotlar va xizmatlar; 5. rim, italiya* - epigenetika va neyrobiologiya; 6. barselona, ispaniya* - to’qima biologiyasi va kasalliklarni modellashtirish. /docprops/thumbnail.jpeg

Хотите читать дальше?

Скачайте все 16 страниц бесплатно через Telegram.

Скачать полный файл

О "biyoinformatikaga oid atamalar va tushunchalar"

бионформатикага оид атамалар ва тушунчалар бионформатикага оид атамалар ва тушунчалар доц. душанова г.а. zamonaviy bioinformatik ma’lumotlar bazalari. zamonaviy genom tadqiqotlarining o’ziga xos belgilaridan biri bu juda katta miqdordagi ketma-ketlik ma’lumotlarini yaratishdir. genomik ma’lumotlar hajmi o’sib borishi bilan, ma’lumotlarni o’chirilishini boshqarish uchun murakkab hisoblash metodologiyasi talab qilinadi. shunday qilib, genomika davridagi birinchi vazifa - bu kompyuter ma’lumotlar bazalarini yaratish va ulardan foydalanish orqali ajoyib hajmdagi ma’lumotni saqlash va boshqarish xisoblanadi. biologik ma’lumotlar bazasi - bu tizimda saqlanadigan ma’lumotlarning tarkibiy qismlarini yangilash, so’rash va olish uchun mo’ljallangan, kompyuterlashtirilgan dasturiy ta’minot bilan bog’...

Этот файл содержит 16 стр. в формате PPTX (1,1 МБ). Чтобы скачать "biyoinformatikaga oid atamalar va tushunchalar", нажмите кнопку Telegram слева.

Теги: biyoinformatikaga oid atamalar … PPTX 16 стр. Бесплатная загрузка Telegram