genlarni kartalashtirish dasturlari bilan tanishish

PPTX 21 стр. 511,9 КБ Бесплатная загрузка

Предварительный просмотр (5 стр.)

Прокрутите вниз 👇
1 / 21
powerpoint presentation genlarni kartalashtirish dasturlari bilan tanishish shaxobiddinova nigina 1. genom xaritalash dasturlari bilan tanishuv 2. dasturlarni tanlash va o'rnatish 3. asosiy funksiyalar va imkoniyatlar reja: amaliy mashg'ulotlar va misollar amaliy mashg'ulotlarda 1000 ta genni o'z ichiga olgan sun'iy genomni yig'ish va uning xromosomalarga joylashishini modellashtirish bo'yicha 5 ta turli xil algoritmlarni taqqoslash mumkin. genom xaritalash dasturi yordamida 20 ta turli xil bakteriya genomlarini tahlil qilish va ularning o'zaro o'xshashlik darajasini (blast algoritmi yordamida) 90% aniqlik bilan aniqlash mumkin. amaliy mashg'ulotlarda, 5 mb uzunlikdagi genomik ketma-ketlikdagi 15 ta snp (single nucleotide polymorphism) ni aniqlash va ularning chastotasini hisoblash bo'yicha mashqlar bajariladi. genom xaritalash dasturlari bilan tanishuv genom xaritalash dasturlari filogenetik daraxtlarni yaratish va turli xil organizmlarning genomlarini taqqoslashda foydali bo'lib, bu esa evolyutsion munosabatlarni aniqlashda 90% gacha aniqlik bilan yordam beradi. genom xaritalash dasturlari, masalan, geneious prime yoki clc genomics workbench, katta hajmdagi genom ma'lumotlarini (gigabaytlar) tahlil qilish va vizualizatsiya …
2 / 21
sh dasturlari 1000 dan ortiq genlarni aniqlash va ularning xromosomalar bo'yicha joylashuvini aniqlashda qo'llaniladi, bu esa genetik kasalliklarni tashxislashga yordam beradi. dasturlarning imkoniyatlari va cheklashlari yuqori aniqlikdagi xaritalashni amalga oshirish uchun, dasturlar ko'p miqdorda ram (masalan, 32 gb dan ortiq) va protsessor yadrolarini talab qilishi mumkin. dasturlar, katta genomlarni (masalan, 10 gb dan ortiq) tahlil qilishda hisoblash quvvati cheklanganligi sababli, vaqt talab qiluvchi boʻlishi mumkin. ba'zi dasturlar faqat ma'lum fayl formatlarini (masalan, fastq, sam/bam) qo'llab-quvvatlaydi, bu esa ma'lumot konvertatsiyasini talab qilishi mumkin. mashhur genom xaritalash dasturlari blast (basic local alignment search tool) kabi algoritmlarni qo'llab-quvvatlovchi dasturlar, nukleotid ketma-ketliklarini 90% dan yuqori aniqlikda taqqoslash imkonini beradi. ba'zi genom xaritalash dasturlari, masalan, "integrative genomics viewer (igv)", katta hajmdagi (10 gb dan ortiq) genom ma'lumotlarini samarali tarzda vizualizatsiya qilish imkoniyatini beradi. mashhur genom xaritalash dasturlari, masalan, "geneious prime" va "clc genomics workbench", 1000 dan ortiq genlarni tahlil qilish va 3d modellashtirish imkoniyatlarini taqdim …
3 / 21
urli xil algoritmlarni, shu jumladan blast va bowtie2 kabi 20 dan ortiq ketma-ketlikni taqqoslash vositalarini oladi. ba'zi dasturlar genomik ma'lumotlarni qayta ishlash uchun 32 bitli va 64 bitli operatsion tizimlar bilan mos keladi, samaradorlikni oshirish uchun parallel hisoblashni qo'llab-quvvatlaydi. dasturlarni tanlash mezonlari ishonchliligi yuqori bo'lgan ma'lumotlar bazalari bilan integratsiyalanish imkoniyati va 5 dan ortiq turli formatdagi fayl bilan ishlash qobiliyatiga e'tibor berish kerak. litsenziyalash shartlari, texnik qo'llab-quvvatlash darajasi va dasturning interfeys foydalanuvchiga qulayligini hisobga olish lozim. dasturning funktsional imkoniyatlarini, masalan, 1000 tadan ortiq genni bir vaqtda tahlil qilish qobiliyatini va 99% dan ortiq aniqlikni baholash muhim. kelajakdagi istiqbollar kelajakdagi genom xaritalash dasturlari 3d vizualizatsiya va sun'iy intellekt texnologiyalaridan keng foydalanishni, tahlil tezligini 10 barobar oshirishni va'da qilmoqda. katta hajmdagi genom ma'lumotlarini qayta ishlash uchun bulutli hisoblash texnologiyalarining integratsiyasi 1000x genomlarni bir vaqtning o'zida tahlil qilish imkonini beradi. genom xaritalash dasturlari, yaqin 5 yilda, shaxsiylashtirilgan tibbiyotni rivojlantirishga hissa qo'shish uchun, aniq …
4 / 21
turlar snp (single nucleotide polymorphism) ma'lumotlarini tahlil qilib, genetik xaritalarni 5cm aniqlikda tuzish imkonini beradi. xaritalash dasturlari yordamida 1000 dan ortiq genni aniqlash va ularning joylashuvini 1 mb aniqlikda aniqlash mumkin. xaritalarni tahlil qilish natijalari 0.01 dan 0.05 gacha p-qiymati bilan statistik ahamiyatga ega bo'lishi mumkin, bu esa genetik bog'lanishni ko'rsatadi. ma'lumotlarni kiritish va qayta ishlash ko'pgina dasturlar 100 000 dan ortiq o'qishlarni (reads) bir vaqtning o'zida qayta ishlashga qodir, bu esa genom montajini tezlashtiradi. fastq formatidagi xom ma'lumotlarni kiritish va keyinchalik bam yoki cram formatiga o'tkazish, ma'lumotlarni saqlash hajmini kamaytirish va tahlilni tezlashtirish imkonini beradi. genom montajida katta hajmdagi ma'lumotlarni qayta ishlash uchun samarali algoritmlar, masalan, de bruijn grafiklari yoki bwa-mem, ishlatiladi. e'tiboringiz uchun rahmat @taqdimot_robot image3.png
5 / 21
genlarni kartalashtirish dasturlari bilan tanishish - Page 5

Хотите читать дальше?

Скачайте все 21 страниц бесплатно через Telegram.

Скачать полный файл

О "genlarni kartalashtirish dasturlari bilan tanishish"

powerpoint presentation genlarni kartalashtirish dasturlari bilan tanishish shaxobiddinova nigina 1. genom xaritalash dasturlari bilan tanishuv 2. dasturlarni tanlash va o'rnatish 3. asosiy funksiyalar va imkoniyatlar reja: amaliy mashg'ulotlar va misollar amaliy mashg'ulotlarda 1000 ta genni o'z ichiga olgan sun'iy genomni yig'ish va uning xromosomalarga joylashishini modellashtirish bo'yicha 5 ta turli xil algoritmlarni taqqoslash mumkin. genom xaritalash dasturi yordamida 20 ta turli xil bakteriya genomlarini tahlil qilish va ularning o'zaro o'xshashlik darajasini (blast algoritmi yordamida) 90% aniqlik bilan aniqlash mumkin. amaliy mashg'ulotlarda, 5 mb uzunlikdagi genomik ketma-ketlikdagi 15 ta snp (single nucleotide polymorphism) ni aniqlash va ularning chastotasini hisoblash bo'yich...

Этот файл содержит 21 стр. в формате PPTX (511,9 КБ). Чтобы скачать "genlarni kartalashtirish dasturlari bilan tanishish", нажмите кнопку Telegram слева.

Теги: genlarni kartalashtirish dastur… PPTX 21 стр. Бесплатная загрузка Telegram