blast dasturi yordamida transkriptlarni olish

PPTX 1,2 МБ Бесплатная загрузка

Предварительный просмотр (5 стр.)

Прокрутите вниз 👇

1711061546.pptx blast dasturi yordamida transkriptlarni olish blast dasturi yordamida transkriptlarni olish transkripsiyani ekstraksiya qilish gen ifodasini tushunishda hal qiluvchi rol o'ynaydi. blast dasturidan foydalanish biologik ketma-ketliklarni solishtirish va o'xshashlikni aniqlash orqali bu jarayonni soddalashtiradi. 1 blast dasturi nima? ma'lumotlar bazasini qidirish blast asosiy mahalliy hizalanishni qidirish vositasini anglatadi va u biologik ma'lumotlar bazalarini ketma-ketlik o'xshashligini qidirish uchun ishlatiladi. algoritmlar u ketma-ketliklar orasidagi muhim mosliklarni topish uchun turli xil algoritmik yondashuvlardan foydalanadi. ma'lumotlar bazasi turlari blast nukleotidlar va oqsillar ma'lumotlar bazalarida qidirishi mumkin, bu tahlillarda ko'p qirralilikni ta'minlaydi. 2 blast (basic local alignment search tool – asosiylokal tekislanishni izlash vositasi) bu kompyuter dasturlaridan biri bo’lib, u oqsil yoki nuklein kislotalar gomologlarini mavjud bazadan izlab topishga xizmat qiladi. sodda qilib tushuntirilganda sizda oqsil yoki nuklein kislotalarning ma’lumbir ketma-ketligi bor. lekin siz bu nuklein kislota qaysi turga tegishli ekanligini bilmaysiz. blast sizga mana shu qo’lingizdagi nukleotidlar ketma-ketligi qaysi turga tegishli ekanligini aniqlashga yordam …

i? buning uchun kompyuterda internetni yoqib aqshning biotexnologik ma’lumotlar milliy markazi (ncbi) saytiga kiramiz. u yerdan blast bo’limi tanlaymiz. bizda quyidagi oyna ochiladi. biz nukleotidlar ketma-ketligini tekshirmoqchi bo’lganimiz uchun chap tomonda turgan nucleotide blast tugmasini bosamiz. kompyuter ekranida quyidagi oyna ochiladi. blast uchun kirish ma'lumotlarini tayyorlash ma'lumotlarni formatlash kirish ketma-ketligi blast talablariga muvofiq to'g'ri formatlanishi kerak, bu esa aniq taqqoslashni ta'minlaydi. ketma-ket tanlash taqqoslash uchun tegishli biologik ketma-ketlikni tanlash mazmunli natijalarga erishish uchun juda muhimdir. 6 nukleotidlarimizni birinchi yuqoridagi qizil ko’rsatgichda ko’rsatilgan joyga ko’chirib olib qo’yamiz (ctrl+c va ctrl+v). shundan so’ng ikkinchi ko’rsatkich ko’rsatayotgan joy belgilanganligini tekshiramiz. bu nuqta siz yuklagan nukleotidlarni qaysi ma’lumotlar ba’zasi bilan solishtirish kerakligini aniqlashtirish uchun kerak. u yerda ayni vaqtda human genomic + transcript – odam genomi va mouse genomic + transcript – sichqon genomi ma’lumotlar bazasi ko’rsatilmoqda. biz others – boshqalar degan bo’limini tanladik. oxirgi ko’rsatkich highly similar sequences – ‘juda ham o’xshash ketma-ketlik’ …

ishli ballarning ahamiyatini va ularning ketma-ketlik o'xshashligiga ta'sirini tushunish. elektron qiymatni hisoblash hizalanish tasodifan sodir bo'lish ehtimolini aniqlash uchun e-qiymatini baholash. sequence identity chuqur tahlil qilish uchun bir xil moslik foizini talqin qilish. 9 natijalarni filtrlash va aniqlashtirish mosliklarni filtrlash eng muhimlariga e'tibor qaratish uchun tegishli bo'lmagan mosliklarni olib tashlash. parametrlarni sozlash aniq tahlil qilish uchun qayta ishlash parametrlarni o'zgartiring. konsensus identifikatsiyasi haqiqiylik va ishonchlilikni o'rnatish uchun konsensus nuqtalarini toping. transkrini chiqarish 10 chiqarilgan transkriptlarni tasdiqlash ketma-ketlik aniqligi transkript soni tadqiqotga mosligini ta'minlash uchun ko'p sonli transkriptlarni tasdiqlash. 11 xulosa va kelajak yo'nalishlari optimallashtirish transkriptni ajratib olish algoritmlarining samaradorligini oshirish integratsiya keng qamrovli tahlil qilish uchun multi-omik yondashuvlarni integratsiyalash tasdiqlash eksperimental usullar orqali olingan transkriptlarni tasdiqlash 12 image1.png image2.png image3.png image4.png image5.jpeg image6.png image7.jpeg image8.png image9.png

blast dasturi yordamida transkriptlarni olish - Page 4

blast dasturi yordamida transkriptlarni olish - Page 5

Хотите читать дальше?

Скачайте полный файл бесплатно через Telegram.

Скачать полный файл

О "blast dasturi yordamida transkriptlarni olish"

1711061546.pptx blast dasturi yordamida transkriptlarni olish blast dasturi yordamida transkriptlarni olish transkripsiyani ekstraksiya qilish gen ifodasini tushunishda hal qiluvchi rol o'ynaydi. blast dasturidan foydalanish biologik ketma-ketliklarni solishtirish va o'xshashlikni aniqlash orqali bu jarayonni soddalashtiradi. 1 blast dasturi nima? ma'lumotlar bazasini qidirish blast asosiy mahalliy hizalanishni qidirish vositasini anglatadi va u biologik ma'lumotlar bazalarini ketma-ketlik o'xshashligini qidirish uchun ishlatiladi. algoritmlar u ketma-ketliklar orasidagi muhim mosliklarni topish uchun turli xil algoritmik yondashuvlardan foydalanadi. ma'lumotlar bazasi turlari blast nukleotidlar va oqsillar ma'lumotlar bazalarida qidirishi mumkin, bu tahlillarda ko'p qirralilikni ta'minlay...

Формат PPTX, 1,2 МБ. Чтобы скачать "blast dasturi yordamida transkriptlarni olish", нажмите кнопку Telegram слева.

Теги: blast dasturi yordamida transkr… PPTX Бесплатная загрузка Telegram