embl - embl nukleotid pusati malumotlar bazasi

DOCX 12 pages 2.9 MB Free download

12 pages

FaylHub.uz

Download via Telegram

Size 2.9 MB

File type DOCX

Pages 12

Updated Dec 2025

Page preview (5 pages)

Scroll down 👇

1 / 12

embl - the embl nucleotide sequence database stoesser g., baker w., van den broek a., camon e., garcia-pastor m., kanz c., kulikova t., leinonen r., lin q., lombard v., lopez r., redaschi n., stoehr p., tuli ma., tzouvara k., vaughan r. (2002), nucl. acids res., 30 (1), 21-26. stoesser g., baker w., van den broek a., camon e., garcia-pastor m., kanz c., kulikova t., lombard v., lopez r., parkinson h., redaschi n., sterk p., stoehr p., tuli m.a. (2001) nucl. acids res., 29, 17-21. baker w., van den broek a., camon e., hingamp p., sterk p., stoesser g., tuli m.a. (2000)nucl. acids res., 28, 19-23. stoesser g., tuli m.a., lopez r., sterk p. (1999) nucleic acids res., 27(1), 18-24. emmert d.b., stoehr p.j., stoesser g., cameron g.n. (1994) nucleic acids res., 22, 3445-3449. база данных нуклеотидных последовательностей европейской молекулярно-биологической лаборатории пополняется большей частью непосредственно авторами, определившими первичную структуру фрагмента днк …

2 / 12

аналогичными базами данных. каждая база данных имеет также свои средства доступа к информации - различные поисковые программы, программные средства визуализации, пополнения базы. крупнейшие хранилища первичных структур днк и аминокислотных последовательностей (такие, как embl, genbank, ddbj, swiss-prot, pir и др.) пополняются аннотированными последовательностями непосредственно исследователями, расшифровавшими их, с помощью автоматизированной системы пополнения баз данных по сети интернет. конечно, впоследствии эти данные проверяются персоналом администраций баз данных и существенно пополняются. вторым основным источником информации во всех базах является специальная научная литература. многие базы данных, работающие над коллекционированием однородной информации, координируют свои усилия, осуществляя международное разделение труда, это можно проиллюстрировать примером сотрудничества трех всемирных коллекций последовательностей нуклеотидов embl (европа), genbank (сша), ddbj (япония). наряду с общими базами данных в последнее время появилось много специализированных информационных ресурсов. многие из них хранят данные, полученные с помощью компьютерных методов, результаты теоретических предсказаний. большую роль в биоинформатике играют хранилища последовательностей днк и кднк, специализированные базы данных по …

3 / 12

ссылки и адреса. для того, чтобы обеспечить ориентирование в этом обширном информационном пространстве, журнал nucleic acids research в течение ряда последних лет первый номер года посвящает описаниям баз данных, сделанным их авторами. список аннотированных ссылок на молекулярно-биологические базы данных, представленный на нашем сайте, обновляется постоянно и отражает положение вещей на сегодняшний день. ammtdb - database of multi-aligned metazoa mitochondrial dna sequences lanave c., licciulli f., de robertis m., marolla a., attimonelli m. (2002) nucl. acids res., 30, 174-175. lanave c., liuni s., licciulli f., attimonelli m. (2000) nucl. acids res., 28, 153-154. lanave c., attimonelli m., de robertis m., licciulli f., liuni s., sbisa e., saccone c. (1999) nucl. acids res., 27, 134-137 attimonelli m., calo d., de montalvo a., lanave c., sasanelli d., tommaseo ponzetta m., saccone c. (1998) nucl. acids res., 26, 120-125. ammtdb - коллекция множественных выравниваний митохондриальных генов, кодирующих белки и трнк у позвоночных животных, а …

4 / 12

синг является важным регуляторным механизмом у высших эукариот. по некоторым оценкам, по меньшей мере 30% человеческих генов сплайсируется альтернативно. с помощью альтернативного сплайсинга можно получить с одного транскрипта до 64 различных мрнк. база данных asdb содержит информацию о белковых продуктах альтернативно сплайсирующихся генов. из базы данных swiss-prot были извлечены все белки, для которых есть упоминание об альтернативном сплайсинге. затем все эти белки разбивались на кластеры. в одни кластер включались белки, которые получились из одного гена (два белка принадлежат одному кластеру, если они имеют общий фрагмент длиной не короче 20 аминокислот и принадлежат одному и тому же организму). определенные таким образом кластеры могут, кроме продуктов альтернативного сплайсинга, содержать белки мультигенных семейств. для исключения таких химерных кластеров применялась процедура множественного выравниваения (программой clustalw). база создана в lawrence berkeley national laboratory (berkeley, us), частично поддерживалась раньше российской программой "геном человека". в настоящее время она не имеет финансовой поддержки, существует исключительно благодаря усилиям авторов, …

5 / 12

25, 265-268. kel o.v., romachenko a.g., kel a.e., wingender e., kolchanov n.a. (1995) nucl. acids res., 23, 4097-4103. база данных по составным регуляторным элементам (composite elements). составной регуляторный элемент содержит два близко расположенных сайта связывания для различных транскрипционных факторов и является минимальной функциональной единицей, которая обеспечивает комбинационную регуляцию транскрипции. эти составные регуляторные элементы геномов, взаимодействуют с двумя и более факторами транскрипции, интегрируя таким образом ответ на некоторые сигнальные пути друг с другом или с механизмами тканевой специфичности или специфичности, связанной с определенной стадией развития организма. различают два типа составных регуляторных элементов - синергичные и антагонистичные все элементы этой коллекции получили экспериментальное подтверждение, поэтому все документы базы содержат информацию о соответствующем типе эксперимента и о специфических взаимодействиях. все документы базы содержат отсылки на соответствующие документы базы данных transfac. адрес: http://compel.bionet.nsc.ru/new/compel/compel.html dbest [dbest] - data base of expressed sequence tags banfi s., guffanti a., borsani g. (1998) trends genet., 14, 80-81. rodriguez-tome …

Want to read more?

Download all 12 pages for free via Telegram.

Download full file

About "embl - embl nukleotid pusati malumotlar bazasi"

embl - the embl nucleotide sequence database stoesser g., baker w., van den broek a., camon e., garcia-pastor m., kanz c., kulikova t., leinonen r., lin q., lombard v., lopez r., redaschi n., stoehr p., tuli ma., tzouvara k., vaughan r. (2002), nucl. acids res., 30 (1), 21-26. stoesser g., baker w., van den broek a., camon e., garcia-pastor m., kanz c., kulikova t., lombard v., lopez r., parkinson h., redaschi n., sterk p., stoehr p., tuli m.a. (2001) nucl. acids res., 29, 17-21. baker w., van den broek a., camon e., hingamp p., sterk p., stoesser g., tuli m.a. (2000)nucl. acids res., 28, 19-23. stoesser g., tuli m.a., lopez r., sterk p. (1999) nucleic acids res., 27(1), 18-24. emmert …

This file contains 12 pages in DOCX format (2.9 MB). To download "embl - embl nukleotid pusati malumotlar bazasi", click the Telegram button on the left.

Tags: embl - embl nukleotid pusati ma… DOCX 12 pages Free download Telegram