gen va oqsil strukturalarini bashorat qilish

PPTX 20 pages 4.0 MB Free download

Page preview (5 pages)

Scroll down 👇
1 / 20
powerpoint presentation gen va oqsil strukturalarini bashorat qilish ahrorbek 1. oqsil va gen tuzilishi o'rtasidagi bog'liqlik 2. oqsil tuzilishini bashorat qilish 3. gen tuzilishini bashorat qilish reja: gen tuzilishini bashorat qilish usullari ab initio modellashtirish, gen ketma-ketligini tahlil qilib, fizik-kimyoviy xossalarga asoslanib, taxminan 50 ta aminokislotali oqsil tuzilishini bashorat qilish imkonini beradi, lekin hisoblash hajmi yuqori. gen tuzilishini bashorat qilishda mashina o'rganish algoritmlari, xususan, chuqur o'rganish tarmoqlari, 90% dan yuqori aniqlik bilan 1000 ga yaqin genni aniqlash imkonini beradi. ab initio modellashtirish ab initio modellashtirishda, fizikaviy va kimyoviy o'zaro ta'sirlarni hisobga oladigan potentsial funksiyalar yordamida, turli xil konformatsiyalarni baholash orqali eng barqaror tuzilmani aniqlashga harakat qilinadi, bu jarayon esa milliardlab mumkin bo'lgan konformatsiyalarni tekshirishni o'z ichiga oladi. ushbu usul, proteinning birlamchi tuzilmasi (aminokislotalar ketma-ketligi) ma'lumotlaridan foydalanib, ikkilamchi va uchlamchi tuzilmalarni bashorat qilishda, taxminan 70% aniqlikka erishadi, bu esa eksperimental usullarga qaraganda ancha arzon va tezkor. rentgen struktura tahlili yuqori intensivli …
2 / 20
shorat qilish uchun graf nazariyasi va mashinani o'rgatishni birlashtiruvchi yangi gibrid yondashuvlarni rivojlantirish, aniqlikni 90% ga oshirish maqsadi bilan. oqsil tuzilishini eksperimental aniqlash usullari yadro magnit-rezonans (nmr) spektroskopiyasi yordamida oqsilning 3d tuzilishi haqida ma'lumot olish mumkin, bu usul 100 kda gacha bo'lgan oqsillarni tahlil qilishga imkon beradi. kriyomikroskopiya oqsil komplekslari va katta oqsillarning tuzilishini 3-4 ångstrom aniqlikda aniqlash imkonini beradi, bu esa dinamik jarayonlarni kuzatishga yordam beradi. ma'lumotlar bazalari va resurslari ncbi's genbank, 200 milliondan ziyod nukleotid ketma-ketliklarini saqlaydigan, genlarning, genomlarning va transkriptlarning tuzilishi va funksiyasi to'g'risida qimmatli ma'lumotlar beradigan muhim resurs hisoblanadi. pfam va interpro kabi oqsil domenlari va familiyalarining ma'lumotlar bazalari, taxminan 18000 dan ortiq oqsil familiyalarini aniqlash va ularning funksiyalarini bashorat qilishda yordam beradigan annotation vositalarini taqdim etadi. fragment asoslangan modellashtirish ushbu usulda, turli xil algoritmlar va ma'lumotlar bazalari (pdb kabi) yordamida o'xshash tuzilmalarga ega bo'lgan oqsil fragmentlari aniqlanib, ular asosida yangi oqsil tuzilmasi bashorat qilinadi. fragment …
3 / 20
ini, ya'ni oqsilning harakatini va konformatsion o'zgarishlarini o'rganish va real vaqtda kuzatish mumkin, bu 10-9 sekunddan 10-3 sekundgacha bo'lgan vaqt oralig'ini qamrab oladi. nmr spektroskopiyasi yordamida 10 kda dan 40 kda gacha bo'lgan kichik oqsillar va peptidlarning strukturasini yuqori aniqlikda aniqlash mumkin. oqsil funksiyasini bashorat qilish oqsil funksiyasini bashorat qilishda, gomologiya modellashtirish va mashinaviy o'rganish algoritmlari kabi turli xil hisoblash usullari qo'llaniladi, ularning har biri o'ziga xos aniqlik va cheklovlarga ega. oqsil funksiyasini bashorat qilishda, 3d tuzilishi ma'lum bo'lgan oqsillar uchun 70% aniqlikka erishish mumkin, ammo yangi, noma'lum ketma-ketliklar uchun aniqlik 50% dan kam bo'lishi mumkin. oqsil tuzilishini bashorat qilish usullari ab initio usullari, kichik oqsillar (100 aminokislotadan kam) tuzilishini bashorat qilish uchun qo'llaniladi va hisoblash quvvati jihatidan talabchan. homologiya modellashtirish usuli, ma'lum tuzilishga 30% dan yuqori ketma-ketlik o'xshashligiga ega bo'lgan oqsillar uchun yuqori ishonchlilik bilan tuzilishni bashorat qiladi. kriyo-elektron mikroskopiya krio-elektron tomografiyasi usuli yordamida hujayraning ichki qismini 3 oʻlchamda …
4 / 20
horat qilish gen funksiyasini bashorat qilishda mashina o'rganish algoritmlari, masalan, 70% aniqlik bilan, oqsil-gen ketma-ketliklarining homologiyasiga asoslangan holda, funksiyani taxmin qila oladi. genning funksiyasi uning 3d tuzilishi va oqsil-oqsil o'zaro ta'siriga bog'liq bo'lib, bu tahlil qilish orqali taxminan 85% ishonchlilik bilan aniqlanishi mumkin. prognozlash dasturlari va vositalari prognozlash dasturlari, gen ketma-ketligini hisobga olgan holda, transkripsiya omillari bog'lanish joylarini aniqlashda 70-80% aniqlikka erishadi va gen ekspressiyasini bashorat qiladi. rosettafold kabi vositalar, oqsil zanjiri ketma-ketligini tahlil qilish orqali, taxminan 1000 aminokislotadan iborat oqsil tuzilmasini prognoz qilishga qodir. gomologiya modellashtirish gomologiya modellashtirishda ma'lum bir oqsilning 3d strukturasini bashorat qilish uchun 70% dan yuqori ketma-ketlik o'xshashligiga ega bo'lgan gomologik strukturadan foydalaniladi. gomologiya modellashtirish algoritmlari, tarkibida 1000 dan ortiq aminokislotalar bo'lgan katta oqsillar uchun ham nisbatan aniq natijalar bera oladi. genlarning transkripsiyasi va translyatsiyasi translyatsiya jarayonida mrnkdagi kodonlarga mos keladigan trna molekulalari 61 ta turdagi aminokislotalarni ribosomalarga yetkazib beradi va shu orqali polipeptid zanjiri hosil …
5 / 20
gen va oqsil strukturalarini bashorat qilish - Page 5

Want to read more?

Download all 20 pages for free via Telegram.

Download full file

About "gen va oqsil strukturalarini bashorat qilish"

powerpoint presentation gen va oqsil strukturalarini bashorat qilish ahrorbek 1. oqsil va gen tuzilishi o'rtasidagi bog'liqlik 2. oqsil tuzilishini bashorat qilish 3. gen tuzilishini bashorat qilish reja: gen tuzilishini bashorat qilish usullari ab initio modellashtirish, gen ketma-ketligini tahlil qilib, fizik-kimyoviy xossalarga asoslanib, taxminan 50 ta aminokislotali oqsil tuzilishini bashorat qilish imkonini beradi, lekin hisoblash hajmi yuqori. gen tuzilishini bashorat qilishda mashina o'rganish algoritmlari, xususan, chuqur o'rganish tarmoqlari, 90% dan yuqori aniqlik bilan 1000 ga yaqin genni aniqlash imkonini beradi. ab initio modellashtirish ab initio modellashtirishda, fizikaviy va kimyoviy o'zaro ta'sirlarni hisobga oladigan potentsial funksiyalar yordamida, turli xil konformat...

This file contains 20 pages in PPTX format (4.0 MB). To download "gen va oqsil strukturalarini bashorat qilish", click the Telegram button on the left.

Tags: gen va oqsil strukturalarini ba… PPTX 20 pages Free download Telegram